Молекулярная характеристика вируса Гиссар (GSRV - Gissar virus) (Bunyaviridae, Phlebovirus, группа Укуниеми), изолированного из клещей Argas reflexus Fabricius, 1794 (Argasidae), собранных в голубятне на территории Таджикистана

Аннотация:

Вирус Гиссар (Gissar - GSRV) был изолирован в 1982 г. от аргасовых клещей Argas reflexus, Fabricius, 1794 (так называемых голубиных клещей), собранных в августе 1982 г. в голубятне над жилым помещением в пос. Гиссар в окрестностях г. Душанбе, Таджикистан (38°40' с.ш., 68°40' в.д.). По данным электронной микроскопии GSRV отнесен к семейству Bunyaviridae, однако его классификация до рода оказалась невозможной вследствие отсутствия антигенных связей с известными буньявирусами. В настоящей работе методом полногеномного секвенирования (next-generation sequencing, платформа lllumina) определена практически полная последовательность генома GSRV, что позволило провести филогенетический анализ и установить его таксономическое положение. GSRV обладает высоким уровнем гомологий (94% по белку нуклеокапсида, 87,5% по RdRp и 82% по оболочечным белкам GnGc) с вирусом Гранд Арбо (Grand Arbaud - GAV), выделенным так же, как и GSRV, из клещей A. reflexus в голубятне во Франции. Независимо от географии распространения GSRV и GAV занимают узкую экологическую нишу, связанную с клещами A. reflexus и птицами (вероятно, преимущественно голубиными Columbidae). На основании проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа GSRV классифицирован как среднеазиатский вариант GAV группы Уукуниеми (Uukuniemi) рода Phlebovirus (Bunyaviridae). (ID GenBank KJ425423, KJ425424, KJ425425).

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2014.-N 4.-С.20-24. Библ. 24 назв.
Просмотров: 55