Компьютерные модели пространственной структуры мутантных белков оболочки вируса гепатита С, влияющих на формирование вирусных частиц

Аннотация:

С использованием результатов предыдущих экспериментов по исследованию N-гликанов гликопротеина Е1 вируса гепатита С в процессе сборки структурных белков вируса в модельной системе — клетках насекомых Sf9 с участием бакуловирусной системы экспрессии, в данной работе представлено моделирование структуры молекулы белка Е1 с разным количеством и расположением гликанов. Компьютерные модели пространственной структуры мутантных белков Е1 построены с использованием метода молекулярной динамики и вычислительных мощностей компьютера. Результаты показывают, что N-связанные гликаны оказывают непосредственное влияние на сворачивание белков Е1, демонстрируя значительные различия в конфигурациях форм таких молекул. Трехмерные модели структуры белка Е1 с мутациями показывают, что N-связанные гликаны оказывают непосредственное влияние на сворачивание Е1, на форму молекулы и, по-видимому, могут играть определенную роль в функционировании этих белков. Данные молекулярного моделирования, полученные в настоящей работе, в целом соответствуют экспериментальным данным, полученным нами ранее. По нашему мнению, комбинации экспериментальных и расчетных подходов могут быть использованы в дальнейших исследованиях, связанных с эффектом мутаций гликопротеинов на репликацию вируса, секрецию вирусных частиц, с ролью отдельных гликанов гликопротеинов ВГС во взаимодействии с рецепторами клетки и проникновении вируса в клетку.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2014
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2014.-N 3.-С.238-243. Библ. 19 назв.
Просмотров: 46