Генетическая характеристика вируса Герань (GERV - Geran virus) (Bunyaviridae, Nairovirus, группа Кальюб), изолированного в Азербайджане от клещей Ornitliodoros verrucosus Olenev, Zasukhin and Fenyuk, 1934 (Argasidae), собранных в норе краснохвостой песчанки (Meriones erythrourus Grey, 1842)

Аннотация:

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ. В работе методом полногеномного секвенирования определена полная нуклеотидная последовательность генома ранее неклассифицированного вируса Герань (Geran virus - GERV, штамм LEIV-10899Az), который изолирован от клещей Ornithodoros verrucosus Olenev, Zasukhin and Fenyuk, 1934 (Argasidae, Or-nithodorinae), собранных в норе краснохвостой песчанки Meriones (Cricedidae) erythrourus Grey, 1842, в окрестностях станции Герань Касум-Исмаиловского района Азербайджана (40°30' N, 46°40' Е) (GenBank ID: KF801649). Показано, что GERV является новым представителем рода Nairovirus (Bunyaviridae). Результаты сравнительного анализа полноразмерных последовательностей генома GERV с другими наировирусами продемонстрировали, что наиболее высокий уровень гомологии (55,6% для N-белка (S-сегмент), 54,2% для полипротеина Gn/Gc (М-сегмент) и 74,8% для РНК-зависимой РНК-полимеразы (L-сегмент)) GERV имеет с вирусом Чим (Chim virus - CHIMV), который также приурочен к убежищным биоценозам (норы грызунов) в Средней Азии и ранее отнесен к группе вируса Кальюб (Qalyub virus - QYBV). При сравнении GERV с доступными последовательностями QYBV (частичная последовательность 413 н.о. гена RdRp) выявили высокий уровень гомологии между ними: 74,3 и 97,4% для нуклеотидной и аминокислотной последовательности соответственно. Полученные данные позволяют классифицировать GERV как вирус группы QYBV рода Nairovirus, сем. Bunyaviridae. В процессе проведения вирусологического мониторинга в Закавказье из пула клещей Ornithodoros verrucosus Olenev, Zasukhin and Fenyuk, 1934 (Argasidae, Ornithodorinae), собранных в норе краснохвостой песчанки Meriones (Cricedidae) erythrourus Grey, 1842 в окрестностях станции Герань Касум-Исмаиловского района Азербайджана (40°30'N, 46°40'Е), изолирован вирус Герань (Geran virus - GERV, штамм LEIV-10899-Az, который не удалось идентифицировать серологическими методами.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2014.-N 5.-С.13-18. Библ. 28 назв.
Просмотров: 69