ГЕНОМНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSP. HOMINISSUIS

Аннотация:

Нетуберкулезные микобактерии Mycobacterium avium subsp. hominissuis (МАИ) способны вызывать микобактериоз у человека. В данной работе приведены результаты первого в России комплексного исследования геномного полиморфизма клинических штаммов МАН с использованием схемы типирования по 13 локусам MATR-VNTR (TR292, TRX3, TR25, TR47, MATR-1, МАTR-4, MATR-5, MATR-6, MATR-8, MATR-11, MATR-14, MATR-15, MATR-16), содержащим тандемные повторы нуклеотидов, и IS1245-RELР-типирования. Изучены 90 штаммов МАН, выделенных в 2008-2011 гг. от эпидемиологически не связанных больных микобактериозом легких (включая ВИЧ-инфицированных). Выявлена неоднородность штаммов МАН (36 вариантов профилей по 13 локусам MATR-VNTR). Большинство (68,8%) изученных штаммов входили в состав 8 кластеров MATR-VNTR; наиболее крупный кластер включал 37 штаммов с 13-значным числовым профилем 2222223145443. В нуклеотидной последовательности локуса MATR-16(3') выявлена протяженная деления (GenBank accession no. KF479191). Штаммы МАН, входящие в состав кластеров MATR-VNTR, были неоднородны по маркеру IS 1245. Метод MATR-VNTR-типирования по 13 локусам целесообразно использовать для предварительной дифференциации российских штаммов МАН с последующим анализом кластеров MATR-VNTR методом IS1245-RFLP-типирования.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2014
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2014.-N 4.-С.14-19. Библ. 15 назв.
Просмотров: 59