Идентификация ключевых элементов нормальной и патогенной микрофлоры, определяющей состояние пародонта, методом NGS-секвенирования банков 16S-рДНК бактериальных консорциумов пародонта

Аннотация:

В работе с применением метола NGS-секвенирования банков суммарной ДНК пародонтальных смывов с праймерами на область V6 16S рДНК проанализирована представленность видов и родов бактерий в микрофлоре пародонта пациентов с агрессивным пародонтитом и лиц со здоровым пародонтом. В результате выявлено 6 родов потенциальных пародонтопротекторов и 8 родов потенциальных пародонтопатогенов, имеющих отношение к риску возникновения агрессивного (но не хронического) пародонтита. Выявлено статистически достоверное повышение представленности у больных агрессивным пародонтитом родов Porphyromonas, Treponema, Synergistes, Tannerella, Fili factor, Ruminococcus, Parvimonas, Mycoplasma, из которых только три Porphyromonas, Treponema и Tannerella традиционно рассматриваются как пародонтопатогены. У лиц со здоровым пародонтом было впервые выявлено статистически достоверное доминирование рода Veillonella, которое, таким образом, должно рассматриваться в качестве важного критерия здоровья пародонта. Роды Streptococcus, Bergeyella, Granulicatella, Kingella и Corynebacterium могут рассматриваться в качестве кандидатных пародонтопротекторов. Проведено сопоставление данных NGS-секвенирования и ПЦР в реальном времени. Показана хорошая воспроизводимость результатов при условии учета различной эффективности реакции ПЦР при использовании независимых пар праймеров.

Авторы:

Издание: Стоматология
Год издания: 2014
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2014.-N 6.-С.25-31. Библ. 27 назв.
Просмотров: 55