Молекулярно-генетическая характеристик вирусного гепатита А в Республике Тыва

Аннотация:

Цель. Определить генетическое разнообразие вируса гепатита A (HAV), циркулирующего на территории с высокой интенсивностью эпидемического процесса. Материалы и методы. Исследовано 1160 образцов сыворотки крови, полученных в 2008, 2010, 2011 и 2012 гг. от больных и лиц с подозрением на вирусный гепатит А из очагов инфекции, проживающих в г. Кызыл и 14 районах Республики Тыва. Также исследовано 19 концентратов проб воды, полученных в 2012 г. из семи населенных пунктов республики. Все образцы были исследованы на наличие РНК ВГА методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). Генотипирование полученных изолятов вируса проводили методом ПЦР с субтипспецифическими праймерами. Для определения принадлежности изолятов вируса к различным штаммам проводилось секвенирование VP1/2B (410 пар нуклеотидов) и 2С (648 пар нуклеотидов) областей генома. Филогенетический анализ проводился с использованием алгоритма Neighbour-joining и байесовского статистического метода (модель HKY85) с помощью программы Geneious 6.0. В результате было обнаружено 177 изолятов ВГА субтипа IA. Большинство изолятов (96%) представляли собой пул генетически близкородственных штаммов вируса, среди которых доминировал штамм U79-U68 (52% изолятов), выявленный в 2008-2012 гг. у больных из г. Кызыл и шести районов Республики Тыва, а также в двух концентратах проб сточной воды из г.Кызыла и села Кызыл-Мажалык (Барун-Хемчикский район). Один штамм (U106) значительно отличался от остальных и был выделен в 2010 г. от семи больных гепатитом А, проживавших в административном центре наиболее отдаленного и труднодоступного района Республики Тыва (село Мугур-АксыМонгун-Тайгинского района). Все обнаруженные на территории Республики Тыва штаммы достоверно отличаются от штаммов HAV субтипа IA, выявленных ранее в различных субъектах европейской и азиатской части РФ и других странах мира, что свидетельствует о длительной эволюции вирусной популяции в условиях воздействия внутренних факторов, обеспечивающих высокую интенсивность эпидемического процесса гепатита А. Выявление в г.Кызыл и шести удаленных друг от друга районах Республики в ходе пятилетнего мониторинга пула уникальных генетически близкородственных штаммов HAV на фоне высоких показателей заболеваемости вирусным гепатитом А свидетельствует о ведущей роли водного пути передачи инфекции в поддержании эпидемического процесса. Для профилактики гепатита А и других инфекций с фекально-оральным механизмом передачи возбудителя инфекции необходима разработка и реализация комплексного плана по улучшению санитарно-коммунального благоустройства населенных мест Республики Тыва. Целесообразно включение вакцинации против гепатита А в региональный календарь профилактических прививок Республики Тыва.

Авторы:

Издание: Инфекционные болезни
Год издания: 2014
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2014.-N 4.-С.24-31. Библ. 25 назв.
Просмотров: 34