ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ОЦЕНКА РАЗМЕРА ПРОТЕОМОВ КЛЕТОК И ПЛАЗМЫ КРОВИ ЧЕЛОВЕКА

Аннотация:

Огромный диапазон концентраций различных протеоформ и недостаточная чувствительность современных методов их детектирования не позволяют пока напрямую определить размеры протеомов (количество всех протеоформ), особенно в плазме. В наших исследованиях была предпринята оценка размера протеомов разного происхождения (начиная с клеток разного типа и заканчивая плазмой человека). Это было сделано на основе использования двумерного электрофореза (2-DE) с последующим окрашиванием белков красителями разной чувствительности. Была определена формула зависимости количества детектируемых полипептидов (пятен) в двумерном геле от чувствительности красителя. Экстраполируя данную зависимость на область чувствительности, позволяющую детектировать самую малую единичную молекулу белка, было подсчитано, что одна клетка человека (HepG2) может содержать около 70000 видов белка, а вся плазма - 1,5 млн. Применение данного подхода к другим клеточным объектам показало правомочность такой экстраполяции. Так, для гепатоцита получилось 70000 протеоформ, микоплазмы (Acholeplasma laidlawii) - 1100, дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) - 40000, Escherichia coli - 6200, Pyrococcus furiosus - 3400. Важность полученных результатов состоит в том, что на их основании можно судить об организации протеома человека и планировать дальнейшие ходы по изучению его функционирования.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2015
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2015.-N 2.-С.279-285. Библ. 41 назв.
Просмотров: 43