ESR - РЕТИНАЛЬНЫЙ БЕЛОК Exiguobacterium sibiricum С НЕОБЫЧНЫМИ СВОЙСТВАМИ

Аннотация:

Рассмотрены свойства ретинального белка (ESR) психротрофной бактерии Exiguobacterium sibiricum, представляющего собой светозависимую протонную помпу. Уникальной структурной особенностью ESR является наличие остатка лизина в положении, соответствующем внутрибелковому донору протонов для основания Шиффа. Мы показали, что Lys96 успешно выполняет в молекуле ESR функцию донора, облегчая доставку протонов с цитоплазматической поверхности белка к основанию Шиффа. Поскольку поглощение протонов предшествует репротонированию основания Шиффа, можно предположить, что в исходном состоянии этот остаток не заряжен и приобретает протон в течение короткого промежутка времени после де-протонирования основания Шиффа и образования интермедиата М. Это отличает ESR от родственных ре-тинальных белков — бактериородопсина (BR), протеородопсина (PR) и ксантородопсина (XR), в которых функцию донора выполняют остатки с карбоксильной группой, протежированные в исходном состоянии. Как и другие протонные помпы эубактерий (PR и XR), ESR содержит остаток гистидина, взаимодейству-щий с акцептором протонов Asp85. Это взаимодействие приводит к сдвигу рКа акцептора в более кислую область по сравнению с PR, обеспечивая его способность к функционированию в широком диапазоне рН. Наличие сильной водородной связи между остатками Asp85 и His57, структура вероятных протонпереносящих путей с цитоплазматической поверхности к основанию Шиффа и к наружной поверхности и другие особенности ESR продемонстрированы благодаря расшифровке его пространственной структуры, которая выявляет ряд отличий от известных структур BR и XR. Структура ESR, схема фотоцикла и реакций переноса протонов обсуждаются в сравнении с гомологичными ретинальными белками.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2015
Объем: 15с.
Дополнительная информация: 2015.-N 6.-С.814-828. Библ. 80 назв.
Просмотров: 32