ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВАРИАНТЫ НОРОВИРУСА ГЕНОТИПА GII.6

Аннотация:

Норовирусы — этиологические агенты острых кишечных инфекций, в основном относятся к генотипу GII.4. Однако норовирусы других генотипов также играют немаловажную роль в некоторые эпидемические сезоны или в отдельных географических регионах. Норовирус генотипа GII.6 в последние годы становится вторым по значимости после GII.4 этиологическим агентом вспышек норовирусной инфекции. Цель: Охарактеризовать генетические варианты норовирусов генотипа GII.6 на основе филогенетического анализа последовательностей генома норовирусов, представленных в базах данных GenBank и NoroNet, а также выявленных на территории Нижнего Новгорода. Путем секвенирования участка генома, кодирующего N/S-домен капсидного белка VP1, идентифицированы норовирусы генотипа GII.6, циркулировавшие при спорадической заболеваемости, а также обусловившие вспышку острой кишечной инфекции на территории Нижнего Новгорода. С использованием программного обеспечения Mega 5.2 проведен сравнительный филогенетический анализ полученных последовательностей и последовательностей, имеющихся в международных генетических базах данных. В результате подтверждено наличие трех генетических вариантов генотипа GII.6 по гену капсидного белка - GII.6a (Seacroft-1990), GII.6b (Saitama-1997) и GII.6c (Shizuoka-2008) в сочетании с двумя генотипами по гену полимеразы - Р6 и Р7. Установлена их коциркуляция с 70-х годов прошлого века, что отражает различия в эволюционных процессах между минорными генотипами норовирусов и доминирующим генотипом GII.4, у которого новые эпидемические варианты полностью вытесняют предыдущие в течение нескольких лет. Норовирусы GII.6, циркулирующие в Нижнем Новгороде и в других городах России, относятся к геновариантам GII.6a и GII.6b. Наиболее широкое распространение в Азии и Европе в последние годы получили рекомбинантные норовирусы GII.P7-GII.6c. Норовирусы геноварианта GII.6c в России пока не обнаружены, однако нельзя исключить вероятность их появления в качестве причины вспышек острых кишечных инфекций на территории нашей страны в ближайшее время.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2015
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2015.-N 4.-С.30-37. Библ. 25 назв.
Просмотров: 31