ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ LEPTOSPIRA SPP. НА ОСНОВЕ 16S рРНК

Аннотация:

Цель. Сравнительное типирование коллекции штаммов Leptospira spp. на основе анализа 16S фрагмента РНК. Материалы и методы. Для ПЦР использовали две пары праймеров, совместно фланкирующих фрагмент размером 1423 п.о. Для филогенетического анализа были использованы последовательности штаммов 16S рРНК Leptospira spp., представленные в международной базе данных. Результаты. Показано высокое сходство, в том числе межвидовое, 16S фрагмента у штаммов Leptospira spp., независимо от источника получения, серовара и серогруппы. Обсуждаются гетерогенность первичной матрицы, спонтанные мутации горячих точек и ошибочные спаривания нуклеотидов, характерные для 16S последовательности патогенных штаммов Leptospira spp. Получена молекулярно-генетическая характеристика некоторых референсных штаммов Leptospira spp. по 16S последовательности. Заключение. Результаты исследований свидетельствуют о целесообразности введения в клиническую практику идентификацию штаммов Leptospira spp. по 16S последовательности непосредственно из клинического материала, что позволит значительно сократить время идентификации, отказаться от сложных типоспецифических сывороток и иных трудоемких методов.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2016
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2016.-N 1.-С.35-39. Библ. 8 назв.
Просмотров: 64