ДНК «МИНИМАЛЬНЫХ» КЛЕТОК (МИКОПЛАЗМ) В МЕТАГЕНОМАХ ВЕЧНОЙ МЕРЗЛОТЫ

Аннотация:

В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ мета-геномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм — патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование flllumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, М5пг, UniProt, Кronа). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31—32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты.

Авторы:

Издание: Гены @ Клетки
Год издания: 2015
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2015.-N 3.-С.12-21. Библ. 40 назв.
Просмотров: 23