ОСОБЕННОСТИ СТРУКТУРЫ И РАСПРОСТРАНЕНИЯ РЕТРОТРАНСПОЗОНА BOV-B LINE

Аннотация:

Мобильные генетические элементы (МЭ) - это повторяющиеся элементы, способные перемещаться по геному и между геномами. Открытые более 60 лет назад Барбарой Мак-Клинток на кукурузе , они не сразу привлекли внимание ученых, и потребовалось более 30 лет, чтобы полностью оценить значимость ее научного открытия. Спустя десятилетия было показано, что они широко распространены в геномах многих растений и животных и являются одним из основных факторов эволюции эу-кариотических геномов. Число их копий может варьировать от нескольких элементов до десятков, сотен, и даже тысяч на геном . Так, у приматов МЭ составляют 35^0% генома, у многих млекопитающих - около половины генома, а в некоторых растениях - до 90% . В последние десятилетия наблюдается бурный прогресс ге-номики, связанный с изобилием информации о полных последовательностях генома у организмов разного таксономического ранга. В результате этого появилось много нового в понимании особенностей функционирования, сохранения и эволюционной истории МЭ. Показано, что они демонстрируют большое разнообразие структуры и механизмов транспозиции. Благодаря способности встраиваться в любой участок генома, МЭ вносят основной вклад в межвидовую дивергенцию и определяют основные механизмы изменчивости как в пределах жизни одного индивидуума, так и в процессе исторического развития организмов. Внедрение МЭ может вызывать перестройки геномной ДНК (дупликации, делеции, инверсии, транслокации), изменять структуру хроматина, влиять на структурные и регу-ляторные участки генов, участвовать в процессе удлинения те-ломер, а также в репарации ДНК. В ходе эволюции вставки МЭ могут изменять транскрипцию близлежащих генов или процес-синг их транскриптов, участвовать в выключении генов, перемещении больших участков ДНК с помощью альтернативной транспозиции или гомологичной рекомбинации. МЭ, играя роль РНК-доменов в составе экзонов, могут быть использованы также как маркеры для определения функций длинной некодирую-щей РНК (IncRNA) . В обзоре рассмотрена история открытия, особенности структуры и распространения одного из МЭ класса I, или ретро-транспозонов, которые перемещаются по геному посредством обратной транскрипции с участием РНК-интермедиатов. Ре-тротранспозон Bov-B LINE (Bov-B) принадлежит к обширному семейству LINE и обнаружен в геномах некоторых млекопитающих и рептилий. Высокое нуклеотидное сходство последовательностей этого элемента у значительно дивергировавших видов, мозаичный характер распределения в пределах класса рептилий и жвачных животных предполагает наличие нетрадиционного механизма распространения Bov-B, а именно горизонтального переноса (ГП, HGT) . Кроме того, недавно фрагмент RT этого элемента обнаружен в геноме нескольких видов кавказских скальных ящериц рода Darevskia . В состав этого видового комплекса входят наряду с бисексуальными видами и несколько партеногенетических видов, полученных в результате скрещивания двуполых родительских видов.Поэтому весьма перспективной и интересной может оказаться информация о динамике и эволюции Bov-B при исследовании этой природной модели сетчатого видообразования. В обзоре кратко представлены данные о классификации мобильных элементов. Особое внимание уделено ретроэлементу из группы LINE - ретротранспозону Bov-B LINE. Рассмотрена история его открытия и распространенность в природе. Приведены данные, свидетельствующие о явлении горизонтального переноса ретротранспозона Bov-B LINE между эволюционно дальними классами.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2016
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2016.-N 1.-С.9-12. Библ. 46 назв.
Просмотров: 37