ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ДЛЯ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ

Аннотация:

Развитие темы обработки данных полногеномного секвенирования геномов микро- и макроорганизмов связано с развитием технологии обработки и анализа нуклеиновых кислот, с быстрым и значительным ростом технических возможностей современных компьютеров и разработок технологий создания программного обеспечения для нужд биоинформатики. Основное назначение информации о полногеномном составе микобактерий туберкулеза и других возбудителей инфекционных заболеваний, аналогичных по природе и патогенезу, - изучение филогенетической природы эпидемических вспышек особо опасных инфекций с целью выявления мишеней для своевременной эффективной антимикробной терапии. По мере увеличения объема знаний и достоверной информации, относящейся к технологии полногеномного секвенирования как темы «больших данных», можно ожидать, что будут раскрыты сравнительные различия различных штаммов микроорганизмов в ракурсе вирулентности, токсигенности, резистентности к различным факторам среды, онко-генности и т. п. Полногеномное секвенирование макроорганизмов и человека имеет схожие черты с этой технологией для более примитивных микроорганизмов, но еще более сложно в связи с более высоким уровнем геномной организации и еще большими объемами получаемых и анализируемых данных . Технологии изучения полных геномов тесно связаны с исследованиями, направленными на поиск ассоциаций генетического набора микро- и макроорганизма и его фенотипа (GWAS - genome wide association studies). Представлен краткий обзор современного программного обеспечения, разработанного для целей анализа данных полных геномов микроорганизмов.

Авторы:

Издание: Туберкулез и болезни легких
Год издания: 2016
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2016.-N 2.-С.47-54. Библ. 83 назв.
Просмотров: 39