КЛАССИФИКАЦИОННЫЕ МОДЕЛИ ВЗАИМОСВЯЗИ СТРУКТУРЫ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СОЕДИНЕНИЙ И ИХ Р-ГЛИКОПРОТЕИНОВОЙ АКТИВНОСТИ

Аннотация:

С использованием методов линейного дискриминантного анализа, случайного леса и опорных векторов созданы 33 классификационные модели субстратной специфичности 177 лекарственных соединений по отношению к Р-гликопротеину. QSAR моделирование проведено с использованием двух стратегий. Первая стратегия заключалась в переборе всех возможных комбинаций из 1+5 дескрипторов на основе 7 наиболее значимых молекулярных дескрипторов с ясной физико-химической интерпретацией. Во втором случае было использовано последовательное включение в модель до 5 дескрипторов, начиная с лучшего одиночного дескриптора. Эту стратегию применяли для набора из 387 DRAGON дескрипторов. В результате было установлено, что только одна из 33-х моделей обладает необходимыми статистическими параметрами. Данная модель была сконструирована с помощью метода линейного дискриминантного анализа на основе одиночного дескриптора Н-связи (ЕCad). Она имеет хорошие статистические характеристики, как внутренней кросс-валидацией, так и внешней валидацией с применением 44 новых соединений. Это подтверждает важную роль водородной связи в процессах, связанных с проникновением химических соединений через гематоэнцефалический барьер.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2016
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2016.-N 2.-С.173-179. Библ. 22 назв.
Просмотров: 38