NG-MAST ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ NEISSERIA GONORRHOEAE, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2012 -2015 ГОДАХ

Аннотация:

Цель: Характеристика современных штаммов N.gonorrhoеae с использованием NG-MAST генотипирования (Neisseria gonorrhoeae multi antigen sequence typing), выявление доминирующих вариантов и анализ их территориального распределения. В работе использованы 440 штаммов N.gonorrhoсae, выделенных в 2012 — 2015 годах на территории 19 субъектов Российской Федерации. Генотипирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов рогВ и tbpB. Идентификацию аллелей и сиквенс-типов осуществляли согласно www.ng-mast.net. В результате идентифицировано 172 NG-MAST генотипа, 100 из которых были описаны впервые. Преобладающими сиквенс-типами являлись 807, 1152, 1544, 5714 и 5941, типичные для нескольких субъектов Российской Федерации и некоторых стран ближнего зарубежья, а также впервые описанные сиквенс-типы 8583 и 9476, получившие исключительное распространение в регионах своего возникновения. Эпидемически значимые в странах дальнего зарубежья сиквенс-типы 225, 1407 и 2992 в настоящем исследовании были представлены единичными изолятами. Показано своеобразие и значительное генетическое разнообразие штаммов N.gonorrhoеae, циркулирующих на территории Российской Федерации, с характерной привязанностью некоторых NG-MAST генотипов к одному или нескольким регионам.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2016
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2016.-N 4.-С.43-50. Библ. 11 назв.
Просмотров: 31