ПЛАСТИДНЫЙ ГЕНОМ Seseli montanum: ПОЛНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ И СРАВНЕНИЕ С ПЛАСТОМАМИ ДРУГИХ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ СЕМЕЙСТВА Apiaceae

Аннотация:

Определена полная последовательность пластидного генома Seseli montanum L. семейства Apiaceae методом высокопроизводительного секвенирования. Полная последовательность генома была депонирована в GenBank под номером КМ035851. Длина пластома S. montanum составляет 147 823 п.н. Пластидный геном имеет типичную для покрытосеменных структуру: большую однокопийную область (LSC) размером 92 620 п.н. и малую однокопийную область (SSC) размером 17 481 п.н., разделенные двумя инвертированными повторами (IRa и IRb) по 18 861 п.н. Состав, порядок генов и АТ-состав пластома Seseli montanum типичны для цветковых растений: всего были идентифицированы 114 уникальных генов, среди которых 30 генов тРНК, 4 гена рРНК и 80 белок-кодирующих генов. Восемнадцать генов имеют интроны: 16 содержат один интрон, два гена (усf3, сlрР) — два интрона. Проведенный сравнительный анализ структуры пластидных геномов Apiaceae показал, что у пластома S. montanum в результате смещения границы LSC/IRb большая часть гена ycf2 (4980 п.н.) локализована в LSC, а часть гена длиной 1301 п.н. остается внутри границ инвертированного повтора. Таким образом, в результате структурных перестроек пластома S. montanum происходит увеличение LSC за счет включения в ее состав большей части гена усf2, в отличие от пластомов восьми зонтичных, у которых ген усf2 целиком входит в инвертированный повтор.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2016
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2016.-N 9.-С.1232-1237. Библ. 23 назв.
Просмотров: 43