ПРЕДСКАЗАНИЕ СЕЛЕКТИВНОГО ТОРМОЖЕНИЯ НЕЙРАМИНИДАЗЫ ВИРУСА ГРИППА РАЗЛИЧНЫХ ШТАММОВ ПОТЕНЦИАЛЬНЫМИ ИНГИБИТОРАМИ

Аннотация:

Создана универсальная модель предсказания торможения нейраминидазы различных штаммах вируса гриппа заданным ингибитором. Она основана на известных данных о трёхмерной структуре (3D) нейраминидазы из различных штаммов вируса гриппа (A/Tokyo/3/67, A/tern/Australia/G70C/75, B/Lee/40), а также моделировании трёхмерной структуры нейраминидазы других штаммов (A/PR/8/34 и A/Aichi/2/68). С использованием докинга и молекулярной динамики были смоделированы 235 комплексов для лигандов с известными значениями 1С50 для 185 соединений. Отбор конечных вариантов из трёх промежуточных для каждой пары белок/лиганд и расчёт независимых переменных для построения уравнений линейной регрессии выполнен с использованием MM-PBSA/MM-GBSA. В результате был получен набор уравнений, как для отдельных штаммов, так и уравнение, объединяющее все данные. Таким образом, результаты данной работы показывают реальную возможность предсказания степени ингибирования нейраминидазы для каждого из рассмотренных штаммов произвольным ингибитором и предсказать спектр его действия на различные варианты вируса гриппа.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2016
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2016.-N 6.-С.691-703. Библ. 41 назв.
Просмотров: 30