СТАТУС МЕТИЛИРОВАНИЯ ГЕНОВ GSTP1, АРС И RASSF1 В ОБРАЗЦАХ РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА: СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ДИАГНОСТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАТИВНОСТИ МЕТОДОВ MS-HRM И ГИБРИДИЗАЦИИ НА ДИК-ЧИПАХ ILLUMINA INFINIUM HUMANMETHYLATION450 BEADCHIP

Аннотация:

В настоящее время существует потребность в молекулярных маркерах рака предстательной железы (РПЖ), уточняющих стратификацию пациентов по категориям риска и дополняющих факторы клинического прогноза. Одним из молекулярных процессов, происходящих при развитии РПЖ, является изменение метилирования ДНК. Для оценки метилирования генов в лабораторной диагностике может быть использована чувствительная к метилированию ПЦР с анализом кривой плавления высокого разрешения (Methylation-Sensitive High Resolution Melting — MS-HRM). Этот метод особенно перспективен с точки зрения небольшого количества требуемой ДНК (10 нг). На сегодняшний день накоплено много данных по изучению уровня метилирования ДНК в образцах РПЖ, полученных с использованием технологии ДНК-чипов "Infinium HumanMethylation450 BeadChip" (НМ450). Однако неизвестно, согласуются ли результаты MS-HRM с данными чип-гибридизации. Целью данной работы был сравнительный анализ диагностической информативности методов MS-HRM и чип-гибридизации НМ450 при определении степени метилирования генов GSTP1, АРС и RASSF1 в образцах, полученных от больных РПЖ. Показано, что метод MS-HRM позволяет дифференцировать образцы опухолевой ткани РПЖ от образцов гистологически неизмененной ткани предстательной железы по уровню метилирования каждого из генов. Анализ данных чип-гибридизации подтвердил результаты, полученные с помощью MS-HRM. Разности уровней метилирования генов GSTP1, АРС и RASSF1 между опухолевой тканью и гистологически неизмененной тканью у каждого больного РПЖ, определённые MS-HRM или гибридизацией на чипах, согласовались друг с другом. Таким образом, оценка уровня метилирования генов GSTP1, АРС и RASSF1 с помощью MS-HRM может стать основой для разработки лабораторного теста, уточняющего диагностику РПЖ.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2016
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2016.-N 6.-С.704-707. Библ. 12 назв.
Просмотров: 41