РАЙОНЫ СО СКРЫТОЙ ПЕРИОДИЧНОСТЬЮ В АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ БЕЛКОВ

Аннотация:

Предложен математический метод поиска скрытой периодичности в аминокислотных последовательностях. Статистическую значимость скрытой периодичности оценивали с помощью метода Монте-Карло. Проведен поиск районов со скрытой периодичностью в аминокислотных последовательностях, представленных в банке данных SWISS-PROT, и показано, что более 10% белков, в том числе и ферментов, содержат участки со скрытой периодичностью. Приведены аминокислотные последовательности со скрытой периодичностью, обнаруженные в липоамиддегидрогеназе (DLDH_AZOVI), аспарагинсинтазе (гидролизующей глутамин) (ASN1_YEAST), эндохитиназе 2 (CHI2_COCIM), Rho/Rac-эффекторе (CTRO_MOUSE). Эти белки обладают районами со скрытой периодичностью длиной в 19, 6, 11 и 7 аминокислотных остатков соответственнно. Обсуждается возможное функциональное и эволюционное значение аминокислотных районов со скрытой периодичностью.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1999
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 1999.-N 4.-С.688-695
Просмотров: 25