ОПРЕДЕЛЕНИЕ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОГО РОДСТВА ШТАММОВ YERSINIA PESTIS ИЗ ПРИРОДНЫХ ОЧАГОВ ЧУМЫ КАВКАЗА МЕТОДОМ МУЛЬТИ-ЛОКУСНОГО VNTR-АНАЛИЗА

Аннотация:

Цель. Определение степени филогенетического родства штаммов Yersinia pestis, выделенных на территориях природных очагов чумы Кавказа, с помощью VNT R-типирования по25локусам (MLVA25). Материалы и методы. В работе использовали 26 штаммов Y. pestis из российских природных очагов Кавказа. Для выполнения мультилокусного VNTR-анал иза использовали 25 локусов тандемных повторов в геноме Y. pestis по схеме Le Fleche. Расшифровку нуклеотидных последовательностей проводили на автоматическом секве-наторе ABI 3130 Genetic Analyser. Анализ приуроченности кластеров к определенным территориям, объектам и срокам изоляции штаммов осуществляли с использованием программы Arc GIS 10.1. Результаты. Сформированы группы М1ЛА25-типов разного уровня дискриминации: кластеры, группы и подгруппы. Кластеры сформированы штаммами различной таксономической принадлежности: основным и полевочьим подвидами Y. pestis. Подгруппы отображают принадлежность штаммов к определенным очагам, а MLVA25-THnbi — степень генетического родства. Заключение. Полученные с помощью MLVA25-TnnoB генетические «портреты» культур возбудителя чумы, циркулирующих на разных природноочаговых территориях, позволяют решать задачи как теоретического, так и практического характера: от трактовки процессов микроэволюции до поиска источника инфекции и путей ее распространения при возможных эпидемических осложнениях. Чума — особо опасное инфекционное природно-очаговое заболевание, способное к эпидемическому распространению с охватом больших масс населения, и характеризуется крайне тяжелым течением с высокой летальностью. Периодическая активность природных очагов, возможность заноса возбудителей с эндемичных территорий на эпидемически благополучные оставляют эпидемическую обстановку достаточно сложной

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2017
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2017.-N 1.-С.35-41. Библ. 9 назв.
Просмотров: 48