РАЗРАБОТКА МЕТОДА АНАЛИЗА ЕДИНИЧНЫХ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ BACILLUS ANTHRACIS С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МИНИСЕКВЕНИРОВАНИЯ И МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ

Аннотация:

Цель исследования: разработка метода SNP-генотипирования В. anthracis с использованием минисеквенирования и MALDI TOF MS. Исследовали ДНК штаммов В. anthracis, масс-спектры олигонуклеотидов с использованием реактивов для ПЦР, масс-спектрометрии, амплификатора ДНК, MALDI TOF масс-спектрометра, методов ПЦР-амплификации, ДНК-секвенирования и MALDI TOF масс-спектрометрии, компьютерных программ, on line ресурса BLASTn и баз данных GenBank. В результате сконструированы праймеры для минисеквенирования 13 канонических SNP В. anthracis, подобран состав нуклеозидтрифосфатов для реакций, отработаны параметры реакций минисеквенирования и MALDI TOF масс-спектрометрии, проверена воспроизводимость и корректность получаемых результатов методами аллель-специфической ПЦР-амплификации в режиме реального времени и прямого секвенирования. Заключение: впервые разработан метод SNP-генотипирования В. anthracis на основе минисеквенирования и MALDI TOF масс-спектрометрии.

Авторы:

Издание: Медицинский вестник Северного Кавказа
Год издания: 2016
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2016.-N 4.-С.565-569. Библ. 8 назв.
Просмотров: 24