АНАЛИЗ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РЕПЕРТУАРОВ АНТИТЕЛ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ УНИКАЛЬНЫХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ ИДЕНТИФИКАТОРОВ

Аннотация:

Использование высокопроизводительного оеквенирования сделало возможным проведение глубокого анализа репертуаров последовательностей гипервариабельных CDR3 участков иммунных рецепторов. Однако способность В-клеточных рецепторов к накоплению на всем протяжении вариабельного домена гипермутаций, неотличимых по своей природе от ошибок ПЦР, а также низкое качество протяженного секвенирования существенно затрудняют анализ репертуаров полноразмерных вариабельных последовательностей иммуноглобулинов. В настоящем обзоре мы показываем, как применение уникальных молекулярных идентификаторов (unique molecular identifiers, UMI) и биоинформатического анализа позволяет получить практически безошибочный репертуар иммуноглобулинов для сложных популяций В-лимфоцитов, содержащих минорные гипермутировавшие подварианты.

Авторы:

Издание: Иммунология
Год издания: 2017
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2017.-N 1.-С.59-63. Библ. 37 назв.
Просмотров: 26