Сравнительный анализ видового состава микрофлоры урогенитального тракта женщин при помощи ПЦР в реальном времени и массового параллельного секвенирования

Аннотация:

ДНК из соскобов урогенитального тракта пациенток с различным содержанием лактобактерий (ЛБ) в общей бактериальной массе (ОБМ) проанализированы при помощи ПЦР в реальном времени и массового параллельного секвенирования (МПС). С помощью обоих подходов проведена количественная оценка содержания ДНК лактобактерий и представителей условно-патогенной микрофлоры (УПМ) в ОБМ и оценена корреляция значений, получаемых разными методами. Наиболее заметная погрешность при определении доли ДНК ЛБ наблюдается в образцах с «промежуточным» их содержанием (от 20 до 80% от суммарной бактериальной ДНК). Пробы с низким содержанием ДНКЛБ характеризуются более высоким видовым разнообразием условно-патогенной микрофлоры, в качестве преобладающего вида ЛБ в таких пробах более часто выступает Lactobacillus iners. В редких случаях ОБМ в клинической пробе преимущественно представлена бактериями, нетипичными для урогенитальной микрофлоры и не выявляемых коммерческими ПЦР-наборами для диагностики дисбиозов урогенитального тракта. В этих случаях оценка состояния биоценоза возможна при помощи МПС.

Авторы:

Издание: Поликлиника
Год издания: 2017
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2017.-N 2(1).-С.37-42. Библ. 17 назв.
Просмотров: 31