ПЦР-АНАЛИЗ АБСОЛЮТНОГО ЧИСЛА КОПИИ ТРАНСКРИПТОВ ХРОМОСОМЫ 18 ЧЕЛОВЕКА В КЛЕТКАХ ПЕЧЕНИ И ЛИНИИ HepG2

Аннотация:

Используя обратную транскрипцию совместно с количественной ПЦР в реальном времени или цифровой капельной ПЦР, проведено профилирование транскриптома хромосомы 18 человека в гепатоцитах печени и клетках гепатобластомы (клеточная линия HepG2) в терминах абсолютного числа копий каждого транскрипта на клетку. Количественная представленность транскриптов варьирует в пределах от 0,006 до 9635 и от 0,011 до 4819 копий на клетку для клеточной линии HepG2 и гепатоцитов печени, соответственно. Обнаружена значительная корреляция между экспрессией генов хромосомы 18 в гепатоцитах и клетках HepG2: коэффициент корреляции Спирмана составил 0,81. Распределение частоты транскриптов по их количественной представленности является бимодальным для клеток линии HepG2 и унимодальным для гепатоцитов печени. Биоинформатический анализ дифференциальной экспрессии генов выявил, что гены хромосомы 18, показывающие повышенную экспрессию в клетках HepG2 по сравнению с гепатоцитами, ассоциированы с процессами клеточного деления и клеточной адгезии. Предполагается, что усиленная экспрессия этих генов связана с пролиферативной активностью культивируемых клеток HepG2. Различия транскриптомных профилей должны учитываться при использовании клеток линии HepG2 в качестве модели гепатоцитов печени.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2017
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2017.-N 2.-С.147-153. Библ. 19 назв.
Просмотров: 23