Penelope-подобные ретротранспозоны в геноме азиатской шистосомы Schistosoma japonicum ftrematoda: Schistosomatidae)

Аннотация:

Мобильные генетические элементы, и в частности ретротранспозоны, составляют значительную часть геномов эукариот и являются одним из основных источников возникновения изменчивости и нестабильности. С момента их открытия прошло уже более шестидесяти лет, и тем не менее отдельные их классы, такие как Penelope-подобные элементы (Penelope-like elements, PLE), остаются малоизученными и по сей день. В настоящей работе мы приводим результаты in silico поиска PLE в геноме азиатской шистосомы S. japonicum - одного из важнейших в эпидемиологическом отношении паразитов человека. Мы приводим новую оценку их представленности в геноме 5. japonicum и показываем, что их высокая гетерогенность отражает, по всей видимости, несколько транспозиционных событий. Показано, что PLE в геноме шистосомы представлены двумя группами канонических копий, различающихся аминокислотными последовательностями доменов RT и EN. Обсуждаются данные по представленности, структурным особенностям, возможной функциональной нагрузке и эволюции Penelope-подобных ретроэлементов паразита.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2017
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2017.-N 1.-С.20-25. Библ. 30 назв.
Просмотров: 37