СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ IN SILICO СВЯЗЫВАНИЯ ПАРАОКСОНА СЫВОРОТОЧНЫМ АЛЬБУМИНОМ ЧЕЛОВЕКА И БЫКА

Аннотация:

Известно, что альбумин способен расщеплять сложноэфирные связи в фосфорорганических соединениях (ФОС). Аминокислоты, отвечающие за эстеразную и псевдоэстеразную активность альбумина по отношению к ФОС, окончательно не установлены, предполагается, что сайт Садлоу I с остатком Туr150 проявляет «истинно» эстеразную активность, а сайт Садлоу II с остатком Tyr411 — псевдоэстеразную. В экспериментах in vitro, направленных на исследование (псевдо)эстеразной активности альбумина по отношению к ФОС, используется как человеческий (ЧСА), так и бычий сывороточный альбумин (БСА). Накоплено множество данных о том, что эффективность взаимодействия различных ксенобиотиков различается для этих двух белков. Цель исследования — на примере параоксона изучить in silico взаимодействие ФОС с выявленными ранее потенциальными сайтами (псевдо)эстеразной активности ЧСА и БСА, оценить возможность ферментативной реакции в этих сайтах, провести сравнительный анализ этих белков с эволюционной точки зрения и оценить возможность экстраполяции экспериментальных данных, полученных на БСА, на человеческий организм. Был проведен молекулярный докинг параоксона в сайты потенциальной (псевдо)эстеразной активности ЧСА и БСА. Методом молекулярной динамики были изучены конформационные изменения полученных комплексов во времени. Показано, что сайт Садлоу II был менее подвержен эволюционным изменениям. Для продуктивного связывания молекулы ФОС и реакции фосфорилирования не требуется связывания модуляторов в других сайтах. Сделан вывод, что для необратимого связывания ФОС в сайте Садлоу II можно ожидать схожие результаты для ЧСА и БСА. Сайт Садлоу I менее консервативен, поэтому для жестких молекул или для оптически активных соединений можно ожидать различную эффективность связывания.

Авторы:

Издание: Журнал эволюционной биохимии и физиологии
Год издания: 2017
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2017.-N 3.-С.170-177. Библ. 40 назв.
Просмотров: 46