БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНОЙ ФРАКЦИИ ПРОТЕОМА PENICILLIUM DIGITATUM

Аннотация:

В исследовании проведено аннотирование масс-спектра, полученного в результате MALDl-TOF-масс-спектрометрии клеточного экстракта мицелия Penicillium digitatum 1, по протоколу, пригодному для видовой идентификации. С использованием серии биоинформационных ресурсов Tagldent, Protein BLAST, Swiss-Model и RaptorX идентифицировали белки и пептиды, с наибольшей вероятностью образующие масс-спектр, также по аминокислотным последовательностям удалось воссоздать их третичную структуру, выявить гомологи среди других видов микромицетов, установить некоторые свойства. В результате проведенной работы выявили и описали в составе низкомолекулярной фракции протеома 33 полипептида, из которых 9 - имеют гомологи у других микромицетов, а 13 - являются уникальными для изученного вида. Большинство исследованных полипептидов ранее были предсказаны только методами молекулярной генетики и не снабжены подробными структурными и функциональными характеристиками.

Авторы:

Издание: Проблемы медицинской микологии
Год издания: 2017
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2017.-N 3.-С.57-63. Библ. 12 назв.
Просмотров: 31