БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ КОЛОКАЛИЗАЦИИ ГЕНОВ РЕЗИСТЕНТНОСТИ И ПРОФАГОВ В МЕТАГЕНОМАХ КИШЕЧНИКА ЧЕЛОВЕКА

Аннотация:

Увеличение доли лекарственно-устойчивых штаммов бактерий непосредственно связано с широким применением антибиотиков в медицине и животноводстве. Предполагается, что микрофлора кишечника служит резервуаром генов антибиотикорезистентности, которые могут передаваться от симбиотических бактерий к патогенным микроорганизмам, в том числе в результате фаговой трансдукции. С использованием программы предсказания профагов PHASTER и базы данных генов антибиотикорезистентности CARD проведён поиск генов антибиотикорезистентности, находящихся в составе профагов, в микробном сообществе кишечника человека. В результате анализа метагеномных сборок восьми образцов в составе последовательностей профагов были обнаружены гены IsaE, mdfA и cpxR/cpxA, присутствие которых обеспечивает устойчивость бактерий к антимикробным пептидам, плевромутилину, линкомицинам, стрептограминам группы А, а также множественную лекарственную устойчивость. Из 659 предположительных профагов, предсказанных в метагеномных сборках, три (0,46%) имели в своём составе гены антибиотикорезистентности.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2017
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2017.-N 6.-С.508-512. Библ. 24 назв.
Просмотров: 30