ХАРАКТЕРИСТИКА ЭНДОНУКЛЕАЗНОЙ ФУНКЦИИ БЕЛКА MutL ИЗ СИСТЕМЫ РЕПАРАЦИИ «МИСМАТЧЕЙ» Rhodobacter sphaeroides

Аннотация:

Впервые выделен белок MutL — компонент системы репарации некомплементарных пар нуклеотидов из бактерии Rhodobacter sphaeroides (rsMutL) и продемонстрирована его эндонуклеазная активность, предсказанная биоинформатическими методами. На основе «выравнивания» 1483 последовательностей бактериальных гомологов MutL с предполагаемой эндонуклеазной активностью проведена оценка степени консервативности функционально значимых мотивов и отдельных аминокислотных остатков. В С-концевом домене rsMutL идентифицированы 5 мотивов, формирующих каталитический центр белка, ответственный за гидролиз ДНК. Выявлено 7 консервативных мотивов, образующих участок связывания АТР и характерных для АТРаз семейства GHKL. Показано, что MutL из R. sphaeroides (rsMutL) наиболее эффективно гидролизует плазмидную ДНК в присутствии ионов Мп2+. Степень расщепления ДНК уменьшается в ряду Mn2+ > Со2+ > Mg2+ > Cd2+. Ионы Ni2+ и Са2+ практически не стимулируют эндонуклеазную функцию MutL. Наличие ионов Zn2+ подавляет гидролиз плазмидной ДНК белком rsMutL в присутствии избытка Мn2+. Показано, что присутствие АТР значительно ингибирует способность rsMutL расщеплять ДНК. На основании анализа данных для всех 5 изученных бактериальных MutL, обладающих эндонуклеазной функцией, показано, что наибольшее сходство как по первичной структуре, так и по биохимическим свойствам, MutL из R. sphaeroides демонстрирует по отношению к MutL из N. gonorrhoeae и P. aeruginosa.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2018
Объем: 15с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.404-418. Библ. 45 назв.
Просмотров: 24