ГЕНОМНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ НЕТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE 01, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ СТРАН

Аннотация:

Помимо занесенных из эндемичных по холере регионов токсигенных штаммов V. cholerae биовара Эль Тор, вызывающих вспышки или спорадические случаи холеры, на территории РФ ежегодно из поверхностных водоемов и от людей выделяют большое количество разных вариантов нетоксигенных штаммов, которые могут быть причиной острых кишечных инфекций. Проведен анализ секвенированых нами (29) и взятых в международной базе данных GenBank (11) полных геномов 40 токсигенных и нетоксигенных штаммов, изолированных на неэндемичных (РФ, Украина, Туркмения, Грузия) и эндемичных (Индия, Бангладеш, Вьетнам и др.) по холере территориях. Установлено, что они образуют три основные группы, отличающиеся по составу мобильных элементов с генами патогенности и эпидемичности как от токсигенных изолятов, так и между собой. Нетоксигенные штаммы первой группы лишены всех интакных профагов вирулентности (СТХф, RS1 ф, TLCф), островов патогенности (VPI-1, VPI-2) и пандемичности (VSP-I, VSP-1I), что подтверждает их эпидемическую безопасность. Штаммы второй группы различались от первой присутствием профага ТLСф и двух островов патогенности. Показано, что такая популяция нетоксигенных штаммов, выявленная лишь в РФ и других неэндемичных по холере регионах, несмотря на наличие генов tcpA-F в составе VPI-1, не может нести потенциальную эпидемическую опасность, как считали ранее. Обнаруженное нами отсутствие у них не только СТХф, но и VSP-1 и VSP-II исключает возможность их реверсии в эпидемически опасные. Штаммы третьей группы имеют явное сходство с токсигенными, отличаясь от них лишь отсутствием профага СТХ<р. Именно эта группа нетоксигенных штаммов, выявленная лишь на эндемичных по холере территориях и способная через фаговую конверсию приобрести СТХф, является потенциально эпидемически опасной. Результаты полногеномного SNP-анализа 58 различных штаммов подтвердили эти данные. Мы также показали на модельных животных (7-8-дневных кроликах), что нетоксигенные штаммы, независимо от структуры их генома, не могут вызвать типичную холерную инфекцию. Полученные результаты дают представление о геномном разнообразии нетоксигенных штаммов, а также приближают нас к пониманию механизмов реверсии разных их вариантов в эпидемически опасные изоляты.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2018
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.76-86. Библ. 26 назв.
Просмотров: 40