ПЦР-СИСТЕМА ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS

Аннотация:

Псевдотуберкулез - острое инфекционное заболевание, вызванное Yersinia pseudotuberculosis. В 1950—60 гг. на Дальнем Востоке РФ были зарегистрированы вспышки нового, неизвестного ранее заболевания, которое было названо «дальневосточной скарлатиноподобной лихорадкой» (ДСП). Результаты микробиологических и клинических исследования, проведенные в последующие годы, позволили установить, что ДСЛ - это псевдотуберкулез, протекающий с особой клинической картиной. Заболевание эндемично для Дальневосточного, Сибирского и Северно-Западного регионов Евразии. Для лабораторной диагностики инфекции с помощью полимеразной цепной реакции в настоящее время существует лишь одна система, предназначенная для выявления одновременно Y. enterocolitica и Y. pseudotuberculosis. К очевидным недостаткам этой системы относится отсутствие возможности специфического выявления Y. pseudotuberculosis. В работе представлена характеристика 35 штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных от больных с диагнозом ДСЛ, на территории РФ за период с 1966 по 2015, по обнаружению плазмидного гена, кодирующего адгезии (yadA), MLST типированию и выявлению хромосомного гена цитотоксического некротизирующего фактора Y. pseudotuberculosis (cnfY). Выявление гена yadA коррелировало с наличием плазмиды (pYV). Штаммы относились к пяти MLST сиквенс-типам (ST), из которых один, ST240, описан впервые. У всех исследованных штаммов Y. pseudotuberculosis показано присутствие гена сnfY. Дополнительно, были проанализированы результаты ранее описанных 68 штаммов Y. pseudotuberculosis. Всего у 103 штаммов было выявлено два аллельных варианта, аллель 1 был обнаружен у всех штаммов, выделенных от больных с ДСЛ. Ген cnfY не является специфически связанным с наличием плазмид. В штаммах Y. enterocolitica ген cnfY отсутствует. Таким образом, ген cnfY является стабильным и специфичным маркером Y. pseudotuberculosis. На основе полученных данных предложена система ПЦР диагностики, для детекции и внутривидовой дифференциации Y. pseudotuberculosis, методом выявления гена cnfY в биоматериале.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2018
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2018.-N 2.-С.92-96. Библ. 12 назв.
Просмотров: 51