РАЗРАБОТКА ПРОТОКОЛА ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ АНАЛИЗА ПРОИСХОЖДЕНИЯ ГЕНОВ РЕАССОРТАНТОВ ПРИ ПОДГОТОВКЕ ШТАММОВ ЖИВОЙ ГРИППОЗНОЙ ВАКЦИНЫ

Аннотация:

Живая гриппозная вакцина (ЖГВ) - эффективное средство профилактики гриппа. Вакцинный штамм ЖГВ получают путем реассортации эпидемических вирусов с холодоадаптированными донорами аттенуации в развивающихся куриных эмбрионах. Важнейшим этапом в подготовке вакцины является молекулярный анализ состава генома полученных реассортантов для выбора подходящих в вакцину штаммов-кандидатов. Необходим метод анализа, позволяющий оперативно и с высокой точностью определять происхождение генов полученных реассортантов. Целью данной работы была разработка протокола пиросеквенирования с использованием PyroMark Q24 для анализа происхождения генов реассортантов при подготовке штаммов ЖГВ для профилактики гриппа А на основе холодоадаптированного донора аттенуации А/Ленинград/134/17/57 (H2N2) и В на основе донора аттенуации В/СССР/60/69 и резервного донора аттенуации В/Ленинград/14/17/55. В задачи исследования входило создание комплекта праймеров для генотипирования реассортантных вирусов подтипов А и В методом пиросеквенирования, разработка оптимального порядка внесения нуклеотидов, оценка эффективности использования разработанного протокола для определения происхождения генов образцов вирусов. Нами была показана возможность использования унифицированного протокола анализа происхождения генов, кодирующих внутренние белки реассортантного вируса гриппа, методом пиросеквенирования с использованием системы PyroMark Q24 при подготовке штамма ЖГВ. Это позволяет осуществлять анализ генома реассортантов современным методом, обладающим высокой чувствительностью и специфичностью, уже на первых этапах подготовки вакцинного штамма.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2018
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2018.-N 2.-С.101-107. Библ. 14 назв.
Просмотров: 32