Молекулярное типирование штаммов Vibrio parahaemolyticus на основе INDEL-маркеров

Аннотация:

Разработан метод генотипирования штаммов Vibrio parahaemolyticus на основе определения делеций-вставок (INDEL-маркеров). Типирование штаммов V. parahaemolyticus, выделенных из морской воды, от гидробионтов и людей в регионах Черного, Азовского, Каспийского, Японского морей с 1972 по 2015 г. проводили по 6 INDEL-локусам. Метод IN DEL-типирования позволил выявить 25 генотипов, которые распределились по 5 кластерам. Выявлена корреляция распределения штаммов V. parahaemolyticus на кластеры в зависимости от наличия генов основных факторов патогенности и принадлежности к пандемичному клону. Вибрионы широко распространены на земном шаре, они являются естественными обитателями пресных и соленых водоемов, а также гидробионтов, обитающих в них. В настоящее время известно около 91 вида вибрионов, 12 из них отнесены к патогенным для человека. Среди галофильных вибрионов по частоте и тяжести вызываемых ими острых кишечных заболеваний особое место занимают парагемолитические вибрионы. Vibrio parahaemolyticus - основная причина пищевых токсикоинфекций, особенно в Японии, Юго-Восточной Азии и Приморском крае. Опасность заражения парагемолитическими вибрионами существует везде, где население использует в питании продукты моря. Вспышки заболеваний возникают в теплое время года в основном в прибрежных районах, но могут встречаться и в местах, удаленных от побережья, что связано с завозом инфицированных продуктов. В организм человека вибрионы попадают при употреблении в пищу сырых или недостаточно обработанных морепродуктов. Вызываемый ими острый гастроэнтерит протекает по типу пищевой токсикоинфекции (ПТИ). Основными факторами патогенности V. parahaemolyticus являются гемолизины - термостабильный прямой (TDH-thermostable direct hemolysin) и TDH-родственный (TDH-related hemolysin), а также 2 контакт-зависимые системы секреции третьего типа (T3SS), особенно T3SS2, ответственная за энтеротоксичность. Заболевания, вызываемые парагемолитическими вибрионами, могут протекать в виде одной из трех клинических форм: гастроэнтеритической, дизентерие и холероподобной. Для быстрой и точной диагностики заболеваний, вызываемых V. parahaemolyticus представляется важным совершенствование схемы изучения биологических свойств вибрионов, в том числе при использовании методов молекулярной биологии. Фундаментальные исследования в области генетики микроорганизмов в последнее десятилетие позволили расширить возможности идентификации микроорганизмов и изучения генетического разнообразия популяций. Применение молекулярных методов внутривидового типирования бактерий позволяет проводить анализ и прогнозировать распространение клонов с повышенной вирулентностью, устойчивостью к внешним факторам и антибактериальным препаратам. Одним из новых молекулярных методов является INDEL-типирование, в основе которого лежит поиск спонтанных вставок/делеций (insertion/deletion) нескольких нуклеотидов, отличающихся по длине у различных организмов. INDEL-метод с успехом применяют для генотипирования как микроорганизмов, так и человека. А.С. Водопьяновым с соавт. разработана система INDEL-типирования Vibrio cholerae, включающая 4 гена и систему специфических праймеров. Сведения об использовании INDEL-типирования для парагемолитических вибрионов в литературе не найдены. Цель исследования - изучение с помощью метода INDEL-типирования коллекционных штаммов V. parahaemolyticus, выделенных на территории РФ.

Авторы:

Издание: Инфекционные болезни. Новости. Лечение. Обучение.
Год издания: 2018
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.26-29. Библ. 14 назв.
Просмотров: 75