Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

Молекулярное типирование штаммов Vibrio parahaemolyticus на основе INDEL-маркеров


Аннотация:

Разработан метод генотипирования штаммов Vibrio parahaemolyticus на основе определения делеций-вставок (INDEL-маркеров). Типирование штаммов V. parahaemolyticus, выделенных из морской воды, от гидробионтов и людей в регионах Черного, Азовского, Каспийского, Японского морей с 1972 по 2015 г. проводили по 6 INDEL-локусам. Метод IN DEL-типирования позволил выявить 25 генотипов, которые распределились по 5 кластерам. Выявлена корреляция распределения штаммов V. parahaemolyticus на кластеры в зависимости от наличия генов основных факторов патогенности и принадлежности к пандемичному клону. Вибрионы широко распространены на земном шаре, они являются естественными обитателями пресных и соленых водоемов, а также гидробионтов, обитающих в них. В настоящее время известно около 91 вида вибрионов, 12 из них отнесены к патогенным для человека. Среди галофильных вибрионов по частоте и тяжести вызываемых ими острых кишечных заболеваний особое место занимают парагемолитические вибрионы. Vibrio parahaemolyticus - основная причина пищевых токсикоинфекций, особенно в Японии, Юго-Восточной Азии и Приморском крае. Опасность заражения парагемолитическими вибрионами существует везде, где население использует в питании продукты моря. Вспышки заболеваний возникают в теплое время года в основном в прибрежных районах, но могут встречаться и в местах, удаленных от побережья, что связано с завозом инфицированных продуктов. В организм человека вибрионы попадают при употреблении в пищу сырых или недостаточно обработанных морепродуктов. Вызываемый ими острый гастроэнтерит протекает по типу пищевой токсикоинфекции (ПТИ). Основными факторами патогенности V. parahaemolyticus являются гемолизины - термостабильный прямой (TDH-thermostable direct hemolysin) и TDH-родственный (TDH-related hemolysin), а также 2 контакт-зависимые системы секреции третьего типа (T3SS), особенно T3SS2, ответственная за энтеротоксичность. Заболевания, вызываемые парагемолитическими вибрионами, могут протекать в виде одной из трех клинических форм: гастроэнтеритической, дизентерие и холероподобной. Для быстрой и точной диагностики заболеваний, вызываемых V. parahaemolyticus представляется важным совершенствование схемы изучения биологических свойств вибрионов, в том числе при использовании методов молекулярной биологии. Фундаментальные исследования в области генетики микроорганизмов в последнее десятилетие позволили расширить возможности идентификации микроорганизмов и изучения генетического разнообразия популяций. Применение молекулярных методов внутривидового типирования бактерий позволяет проводить анализ и прогнозировать распространение клонов с повышенной вирулентностью, устойчивостью к внешним факторам и антибактериальным препаратам. Одним из новых молекулярных методов является INDEL-типирование, в основе которого лежит поиск спонтанных вставок/делеций (insertion/deletion) нескольких нуклеотидов, отличающихся по длине у различных организмов. INDEL-метод с успехом применяют для генотипирования как микроорганизмов, так и человека. А.С. Водопьяновым с соавт. разработана система INDEL-типирования Vibrio cholerae, включающая 4 гена и систему специфических праймеров. Сведения об использовании INDEL-типирования для парагемолитических вибрионов в литературе не найдены. Цель исследования - изучение с помощью метода INDEL-типирования коллекционных штаммов V. parahaemolyticus, выделенных на территории РФ.

Авторы:

Чемисова О.С.
Водопьянов А.С.
Рыковская О.А.
Водопьянов С.О.
Голенищева Е.Н.

Издание: Инфекционные болезни. Новости. Лечение. Обучение.
Год издания: 2018
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.26-29. Библ. 14 назв.
Просмотров: 74

Рубрики
Ключевые слова
cholerae
in
parahaemolyticus
vibrio
азов
анализ
антибактериальные
бактерии
биологический
биология
болезни
быстрый
вибрион
вирулентность
включения
внешними
внутри
вода
водоемы
возможности
время
вспышки
вставочный
встречный
выделение
вызываемые
гастроэнтерит
гемолизин
гена
генетика
генетическ
генов
генотип
генотипирование
гидробионты
года
делеция
диагностика
дизентерия
длина
естественная
заболевания
зависимости
заражение
земного
идентификации
изучение
инфекционные
инфицированная
использование
исследование
каспий
кишечная
кластер
клиническая
клоны
ключ
контакт
корреляция
литература
людей
места
место
метод
методов
микроорганизмов
молекулярная
морепродукты
морская
моря
наличия
население
настоящие
недостаточное
нескольким
новые
нуклеотидов
областей
область
одного
опасности
определение
организм
основа
основной
особо
особый
острая
ответ
пандемия
парагемолитический
патогенность
патогенные
питание
пищевая
пищевой
повышенная
поза
поиск
помощи
популяции
послед
праймер
препараты
пресная
прибрежная
применение
приморский
принадлежности
причина
прогноз
продуктов
протек
прямая
пти
различный
район
распределение
распространение
регион
ростовская
свойства
связей
секреции
систем
слова
совершенствование
солевая
специфическая
спонтанная
среда
схема
сыр
тепло
термостабильный
территории
типа
типирование
типу
токсикоинфекция
точная
третья
тяжести
употребление
успехе
устойчивости
фактор
холера
цель
частота
человек
черная
число
шара
широкая
штамм
японский
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 18.191.168.142)
Яндекс.Метрика