Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, выделенных на территории Республики Крым в 2015-2017 гг.

Аннотация:

В июне 2017 г. зарегистрирован первый с 1967 г. случай крымской геморрагической лихорадки (КГ/1) в Республике Крым. Методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) исследовано 183 пула иксодовых клещей, собранных при проведении эпизоотологического обследования 5 административных районов Республики Крым, в 29 (15,9%) пулах обнаружена РНК вируса Крым-Конго (КК). Цели работы - молекулярно-генетическая характеристика РНК-изолятов вируса КК, выявленных в образцах клинического и полевого материала, полученных в Крыму в 2017 г., и сравнительный анализ генетических вариантов вируса КК, циркулировавших на территории Республики Крым в 2015-2017 гг. Материал и методы. Исследованы 1 проба крови больного КГЛ, выявленного в 2017 г. в Республике Крым, и 29 пулов иксодовых клещей, положительных на наличие РНК вируса КК, собранных в 2017 г. в Черноморском и Ленинском административных районах Республики Крым. Генетическую идентификацию вируса КК осуществляли методом секвенирования фрагментов S-, М- и L-сегментов генома вируса. Филогенетический анализ проводили в программе Меда 5.05 методом Neighboorjoining, по алгоритму Kimura-2. Результаты. Определена нуклеотидная последовательность фрагментов S-, М- и L-сегментов генома РНК-изолятов вируса КК, выявленных в образце сыворотки крови больного КГЛ и в 6 пробах суспензий клещей с достаточной вирусной нагрузкой. В результате секвенирования фрагментов генома РНК-изолятов вируса КК установлено, что в 2017 г. в Республике Крым одновременно циркулировали изоляты вируса КК генотипа «Европа-1», принадлежащие к субтипам Va «Ставрополь-Ростов-Астрахань» и Vd «Крым». В 2015 г. в Крыму были выявлены только штаммы субтипа Vd. Субтип Vd «Крым» является эндемичным генетическим вариантом вируса КК для Крымского полуострова. РНК-изоляты вируса КК субтипа Va «Ставрополь-Ростов-Астрахань» ранее на территории Республики Крым не выявляли. Появление в 2017 г. на территории Крыма штаммов вируса КК субтипа Va, возможно, связано с заносом инфицированных вирусом КК клещей, при транспортировке крупного и мелкого рогатого скота в Крым с территории субъектов юга России, энзоотичных по КГЛ. Для оценки генетической гетерогенности популяции вируса КК в Республике Крым и выявления закономерностей распределения генетических вариантов необходимо дальнейшее проведение молекулярно-генетических исследований штаммов и РНК-изолятов вируса КК, выявляемых на территории Республики Крым.

Авторы:

Издание: Инфекционные болезни. Новости. Лечение. Обучение.
Год издания: 2018
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.41-48. Библ. 11 назв.
Просмотров: 23