ИДЕНТИФИКАЦИЯ микроРНК В КЛЕТКАХ КОЖИ КИТАЙСКОЙ ГИГАНТСКОЙ САЛАМАНДРЫ (Andrias davidianus) МЕТОДОМ ГЛУБОКОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ

Аннотация:

МикроРНК (miRNA) играют ключевую роль в регуляции широкого круга биологических процессов, проявляя свое действие через расщепление мРНК или подавление трансляции. Однако до сих пор не было сообщений о микроРНК из кожи A. davidianus. В настоящей работе была получена библиотека кДНК малых РНК клеток кожи A. davidianus и проведено их секвенирование. Всего было идентифицировано 513 консервативных микроРНК, входящих в 174 известных семейства. Другие 108 микроРНК были определены нами как новые микроРНК, которые, скорее всего, специфичны для клеток кожи, но при этом экспрессируются в малых количествах. Случайным образом были отобраны 15 микроРНК для определения уровня их экспрессии в восьми различных тканях из A. davidianus с помощью метода количественной ОТ-ПЦР «стебель—петля». Для определения возможных функций этих микроРНК с использованием базы данных онтологии генов (GO) был проведен анализ 129 791 генов, которые предположительно могут быть мишенями для этих микроРНК, а ассоциированные с ними сигнальные пути были проиллюстрированы с помощью анализа сигнальных путей KEGG. Полученные результаты свидетельствуют о том, что идентифицированные в настоящей работе микроРНК из кожи A. davidianus вовлечены в широкий круг физиологических функций, включая метаболизм, рост, развитие и иммунный ответ. В настоящей работе проведен исчерпывающий анализ микроРНК и их генов-мишеней, который в конечном итоге будет способствовать лучшему пониманию их роли в коже A. davidianus и других земноводных. Для улучшения понимания роли микроРНК в регуляции генов необходимо проведение дальнейших исследований.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2018
Объем: 15с.
Дополнительная информация: 2018.-N 7.-С.1046-1060. Библ. 48 назв.
Просмотров: 20