Пространственное расположение одиночных аминокислотных замен в белках холодоадаптированных штаммов вируса гриппа В и их возможная роль в холодовой адаптации

Аннотация:

В обзоре представлен анализ расположении уникальных аминокислотных замен в белках холодоадаптированных вирусов гриппа В — доноров аттенуаиии живых гриппозных вакцин: B/Ann Arbor/1/66ca, В/СССР/60/69, В/Ленинград/14/17/55, В/Виктория/2/63/87, B/Vienna/1/99ca. Анализ выполнен на основе данных о последовательности вирусов и сведений о функциональной организации вирусных белков. Приводится описание основных особенностей структуры внутренних белков вирусов гриппа В и современного представления о функционировании их доменов. В обшей сложности у рассмотренных холодоадаптированных вирусов гриппа В описаны 35 замен в белках рибонуклеопротеинового комплекса (РВ1 (3), РВ2 (10), РА (11), NP (11)]. Всего насчитываются 44 аминокислотные позиции, изменения в которых связывают с холодовой адаптацией. Наиболее подверженными изменениям у рассмотренных вирусов оказались домены белков, вовлеченные в белок-белковые взаимодействия. В полимеразном комплексе самое большое число замен было обнаружено в С-кониевых доменах белков РА и РВ2, формирующих наружные части структуры и обеспечивающих взаимодействие субъединиц между собой, с клеточными факторами и нуклеопротеином. Замены в нуклеопротеине расположены в областях, отвечающих за олигомеризацию NP (гибкий N-кониевой фрагмент), а также за взаимодействие с полимеразным комплексом (наружная поверхность тела и головки NP). У всех холодоадаптированных вирусов обнаружены изменения в 7-м сегменте генома, приводящие к аминокислотным заменам в матриксном белке или протонном канале ВМ2. Анализ расположения замен приводит к выводу о важнейшей роли констелляции генов, кодирующих внутренние белки холодоадаптированных вирусов, в аттенуации.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2018
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2018.-N 3.-С.13-24. Библ. 53 назв.
Просмотров: 17