СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МЕТОДОВ LAMP И ПЦР-РВ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САПА И МЕЛИОИДОЗА

Аннотация:

Представлены результаты выявления ДНК штаммов Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei с помощью петлевой изотермической амплификации (LAMP) и ПЦР с детекцией продукта в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Показано, что в ПЦР-РВ праймеры надежно выявляли ДНК тех микроорганизмов, к последовательностям которых они были сконструированы. ДНК гетерологичных штаммов указанные праймеры не выявляли. При проведении LAMP ни один набор праймеров не показал высокой аналитической чувствительности и специфичности. Праймеры выявляли ДНК не всех исследованных штаммов, к генам-мишеням которых они были рассчитаны, но были способны направлять синтез фрагментов генов гетерологичных штаммов. При этом результаты повторных экспериментов плохо воспроизводились. Неудачи при проведении LAMP могут быть обусловлены наличием GC-богатых областей в геноме Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei и формированием вторичных структур в изотермических условиях В случае таких сложных для LAMP матриц, как ДНК Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei, рекомендуется использовать ПЦР-РВ для детекции возбудителей.

Авторы:

Издание: Клиническая лабораторная диагностика
Год издания: 2018
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2018.-N 6.-С.378-384. Библ. 29 назв.
Просмотров: 34