РАЗРАБОТКА И ВЕРИФИКАЦИЯ ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО НLА-ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ ДОНОРОВ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК

Аннотация:

Представлены данные о разработке и верификации отечественной тест-системы для высокопроизводительного HLA-генотипирования с использованием платформы Illumina MiSeq System. Разработанная тест-система включает в себя все компоненты, необходимые для таргетного обогащения пяти генов HLA и приготовления библиотек. Учет результатов осуществляется с использованием специализированного программного обеспечения для автоматического анализа данных. Тест-система верифицирована на выборке из 93 образцов ДНК с известными HLA-генотипами. В ходе верификации определены чувствительность и специфичность тест-системы по каждому из HLA-локусов: для локусов А и В они составили 1.0 и 1.0 соответственно, для локуса С - 1.0 и 0.99, для локуса DRB1 - 0.98 и 0.99, для локуса DQB1 - 0.98 и 0.93. В последние годы молекулярно-генетические методы, основанные на технологии секвенирования нового поколения (NGS - Next Generation Sequence), находят все более широкое практическое применение. Одним из важнейших направлений, где применение указанной технологии следует признать перспективным и экономически обоснованным, является массовое HLA-типирование потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток (ГСК), заключивших информированное согласие на вступление в российские регистры. По состоянию на 11 октября 2018 г., число потенциальных доноров ГСК, зарегистрированных в объединенной базе данных о российских донорах BMDS (Bone Marrow Donor Search), составляет 85181 человек, в неё включены сведения о донорах 15 локальных регистров, действующих в 11 регионах Российской Федерации. Такое количество безвозмездных доноров на сегодняшний день уже обеспечило 229 трансплантаций ГСК для пациентов российских клиник. В последние пять лет наметился явный прогресс во взаимодействии трансплантационных клиник с BMDS, однако многие российские пациенты по-прежнему зависят от донорского материала, получаемого из-за рубежа, либо вообще остаются без совместимого неродственного донора. Цель работы - разработка и верификация тест-системы для высокопроизводительного HLA-типирования.

Авторы:

Издание: Клиническая лабораторная диагностика
Год издания: 2018
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2018.-N 12.-С.788-792. Библ. 4 назв.
Просмотров: 27