Особенности структуры генома штаммов возбудителя чумы из разных природных очагов, позволяющие проводить внутривидовую дифференциацию

Аннотация:

Геномы штаммов различных подвидов возбудителя чумы неоднородны. В процессе формирования различных подвидов и биотипов Yersinia pestis при эволюционном развитии появились специфические метки в геномах этих групп штаммов. Одним из отличительных признаков является неоднородность нуклеотидных последовательностей плазмиды pFra у различных подвидов. В статье представлены данные о структурной организации pFra плазмиды у различных подвидов возбудителя чумы. В результате изучение 87 штаммов Y. pestis подтвердило наличие нуклеотидной последовательности (CDS38-CDS40). Эти последовательности стабильно присутствуют в плазмиде pFra штаммов неосновных подвидов и отсутствуют у штаммов основного подвида. Характерной особенностью штаммов подвида caucasica также является присутствие в pFra большого фрагмента ДНК, содержащего гены traоперона. Исследование состава генов tra-оперона выявило ряд стабильно присутствующих генов в pFra этого подвида. На основании результатов исследования выбраны специфические последовательности, использованные для создания набора, который позволяет дифференцировать штаммы основного подвида от штаммов неосновных подвидов, а также выявлять штаммы подвида caucasica. Представлен вариант схемы идентификации внутривидовой дифференциации Y.pestis.

Авторы:

Издание: Инфекционные болезни. Новости. Лечение. Обучение.
Год издания: 2019
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2019.-N 1.-С.64-73. Библ. 18 назв.
Просмотров: 23