ОБНАРУЖЕНИЕ микроРНК У Batrachuperus yenyuanensis С ПОМОЩЬЮ МЕТОДА ГЛУБОКОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ И ПРЕДСКАЗАНИЕ ИХ ВЕРОЯТНЫХ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ

Аннотация:

МикроРНК (miRNAs) образуют семейство одноцепочечных некодирующих молекул РНК, образованных -22 нуклеотидами каждая, которые рассматриваются как ключевые пост-транскрипционные регуляторы экспрессии генов, оказывающих большое влияние на различные биологические процессы в живых организмах. У животных были выявлены многочисленные микроРНК, однако лишь малое их количество было идентифицировано у видов углозубых (Hynobiidae). Поэтому целью настоящей работы была идентификация полного набора микроРНК у Batrachuperus yenyuanensis (Длиннохвостый углозуб), которая может способствовать значительному повышению уровня наших знаний о микроРНК земноводных. Была создана библиотека малых РНК из В. yenyuanensis, которая затем была подвергнута анализу с помощью метода глубокого секвенировапия. В результате проведенного секвенирования, были получены 1717751 чистых ридов (прочтений), которые соответствовали 356-ти уже известных микроРНК и 80-ти новым. Кроме того, были подтверждены уровни экспрессии восьми отобранных случайным образом микроРНК В. yenyuanensis с помощью метода количественной ОТ-ПЦР «стебель—петля». Также, были предсказаны 13 972 возможные мишени для этих идентифицированных микроРНК, хотя физиологические функции для многих мишеней этих микроРНК остаются до сих пор не выясненными. Затем проведенный анализ онтологии генов (GO — Gene Ontology) и обогащения путей KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) позволили предположить, что эти предсказанные мишени вовлечены в большое многообразие физиологических функций у В. yenyuanensis. Полученные результаты предоставили полезную информацию для проведения дальнейших исследований микроРНК, которые вовлечены в процессы роста и развития представителей вида В. Yenyuanensis и способствуют их адаптации в сложной для проживания высокогорной местности.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2019
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2019.-N 4.-С.520-531. Библ. 56 назв.
Просмотров: 12