Интегроны классов 1 и 2 в госпитальных штаммах грамотрицательных бактерий, выделенных в Москве и регионах Российской Федерации

Аннотация:

Природные системы клонирования и экспрессии мобильных генных кассет, улавливаемых с помощью сайтспецифической рекомбинации, интегроны классов 1 и 2 играют большую роль в мобилизации и распространении генетических детерминант антибиотикорезистентности у грамотрицательных бактерий возбудителей инфекций человека, особенно в госпитальной среде. Генные кассеты, локализованные в вариабельной части интегронов, детерминируют устойчивость к антибактериальным препаратам (АП) разных функциональных классов. Цель работы — детекция и характеристика интегронов классов 1 и 2 у грамотрицательных бактерий, выделенных в многопрофильных стационарах Москвы и других регионах РФ в 2003—2015 гг. Клинические штаммы грамотрицательных бактерий (п=1248) обладали преимущественно фенотипом множественной лекарственной устойчивости (94%) — 10% штаммов были устойчивы к АП трех функциональных групп, 19% — четырех, 42% — пяти, 17% — шести, 7% — семи. Высокий уровень устойчивости изучаемых штаммов к бета-лактамам ассоциирован с наличием у них генов бета-лактамаз типов blaTEM(35% штаммов), blaSHV(25%), blaCTX-M(38%), blaOXA (31%), blaVIM (3%) и blaNDM (2%), а к АП других функциональных групп — с наличием интегронов класса 1(59%) и интегронов класса 2(8%). Большая часть интегронов класса 1(54%) и интегронов класса 2(88%) содержали в своей вариабельной части 22 варианта наборов генных кассет в интегронах класса 1 и 4 варианта — в интегронах класса 2. В ходе исследования идентифицированы генные кассеты 31 типа (в том числе наиболее распространенные aadB, аасА4, аасС1, aadAl, aadA2, aadA5, blaVIM-2, dfrA1, dfrA7, dfrA12, orfC, orfE, orfY и sat1), ассоциированные с устойчивостью штаммов к аминогликозидам, хлорамфениколу, сульфаниламидам и бета-лактамам, а также кассеты orf, кодирующие белки с неизвестными функциями. Идентифицированы новые наборы генных кассет: dfrA12s-orfF-aadA2 (In1249) и dfrA1-IS911-sat1-aadA1 (not numbered).

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2019
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2019.-N 1.-С.17-24. Библ. 28 назв.
Просмотров: 29