Анализ иммуномодулирующих белков вируса африканской чумы свиней

Аннотация:

Молекулярная эпидемиология вирусных инфекций традиционно основывается на анализе изменений отдельных генов или генетических маркеров. Анализ генов вируса африканской чумы свиней (АЧС), кодирующих иммуномодулирующие белки является важным инструментом изучения разнообразия и эволюции вируса. В данной работе мы провели структурный и филогенетический анализ иммуномодулирующих белков 5е/(ген A238L), i14l(ген DP71L), k11l (ген I329L) вируса АЧС. Степень нуклеотидных замен конкатенированных генов A238L, l329L и DP71L вируса АЧС выявила очищающий (стабилизирующий) отбор на уровне нуклеотидных последовательностей. Характеристика вариабельности отобранной нами группы генов вируса АЧС представляет большой интерес для поиска генетических различий в иммуномодулирующих белках. Результаты секвенирования генов A238L, I329L и DP71L и их филогенетический анализ показали, что эти гены являются консервативными среди большой группы генов вируса АЧС. Ген l329L является генетическим маркером общности происхождения. Ген DP71L у восточноафриканских штаммов X генотипа имеет две формы: длинную (184 аминокислоты) и краткую (от 70 до 72 аминокислот) и образуется путем слияния 13L и 14L. Все российские изоляты вируса АЧС, выделенные в 2016—2017 гг., по изученным генам идентичны референтному штамму ASFV/Georgia/wb/2007. Характеристика вариабельности белков 5е1, И41, kill может послужить выявлению таргетных участков в геноме вируса АЧС и для разработки вакцин. Полученные данные позволяют оценить генетическое разнообразие иммуномодулирующих белков вируса АЧС и динамику их эволюции, предсказать возможное участие генов A238L, I329L и DP71L в вирулентности различных штаммов вируса АЧС.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2019
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2019.-N 1.-С.42-48. Библ. 34 назв.
Просмотров: 21