МИКРОБНОМ РЕСПИРАТОРНОГО ТРАКТА ДЕТЕЙ С МУКОВИСЦИДОЗОМ

Аннотация:

Цель исследования: Изучение влияния комплекса факторов на состав микробиоты респираторного тракта детей и выявление маркеров клинических состояний пациента. Материал и методы. 94 образца от 60 пациентов в возрасте 3 мес. - 18 лет были исследованы методом массового параллельного секвенирования ампликонов гена 16S rDNA на платформе MiSeq Illumina. Полученные данные анализировали с помощью Microbial Genomics Module программы CLC Genomic Workbench v.9 - 11. Результаты. Показаны значительные отличия микробных сообществ носовых пазух, зева и легких. Для образцов из зева продемонстрирована связь состава микробиоты с возрастом, ОФВ1, клиническим состоянием и классом мутации. В старшей возрастной группе (13-18 лет) в микробиоме зева, повышается доля Proteobacteria и снижается количество «здоровых» таксонов, относящихся к Actinobacteria и Bacteroidetes. В группе с пониженной функцией легких наблюдали более высокий уровень Firmicutes в зеве (83 %), при снижении Proteobacteria и Actinobacteria. Анализ взаимосвязи тяжести состояния пациента и микробиоты зева выявил, что в период обострения происходит повышение доли Proteobacteria (до 46%) и снижение доли Firmicutes (до 38%). Обратную тенденцию наблюдали для образцов из легких. Показано, что применение антибиотиков как в отсутствии обострения, так и в стабильном состоянии изменяет состав микробиомного сообщества. На примере одного пациента установлено, что переход в состояние обострения может быть связан с минорными изменениями некультивируемых анаэробных таксонов. Заключение. Таким образом, полученные данные показывают, что исследования микробиома являются одним из наиболее перспективных направлений для выявления надежных биомаркеров состояния респираторного тракта пациентов с MB, оценки результатов терапии и прогнозирования клинических исходов.

Авторы:

Издание: Сибирское медицинское обозрение
Год издания: 2019
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2019.-N 2.-С.19-28. Библ. 17 назв.
Просмотров: 24