ПРИМЕНЕНИЕ СОВРЕМЕННЫХ МЕТОДОВ В МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКЕ ХРОНИЧЕСКОЙ ИНФЕКЦИИ ЛЕГКИХ У БОЛЬНЫХ МУКОВИСЦИДОЗОМ

Аннотация:

Цель исследования: Обосновать применение комплексного подхода с использованием современных методов идентификации микроорганизмов для микробиологической диагностики ХИЛ у больных муковисцидозом и подтвердить его эффективность. Материал и методы. Исследованы 2300 мазков из зева и образцов мокроты от больных MB и штаммы S. aureus, P. aeruginosa, Всс и Achromobacter spp., выделенные от больных MB с 2006 по 2018 гг. Использовали бактериологические, биохимические и молекулярно-генетические методы, а также MALDI-TOF. Результаты. Показано, что применение только классических бактериологических методов не обеспечивают достоверную этиологическую диагностику. Установлено, что наиболее трудно с помощью бактериологических методов является идентификация бактерий Achromobacter spp. и Burkholderia cepacia complex. В результате исследования с помощью MALDI-BIOTYPERtm был о идентифицировано 90 видов бактерий, которые были выделены из зева и мокроты больных муковисцидозом. Изоляты Achromobacter spp., выделенные от российских больных MB, с помощью MALDI-BIOTYPERtm были отнесены к A. ruhlandii, A. xylosoxidans, A. insolitus, A. piechaudii, A. insuavis, A. spanius, среди которых 76% принадлежали к виду A. ruhlandii и 7,2% к виду A. xylosoxidans. Для дифференциации бактерий Всс и Achromobacter spp. до вида необходимо использовать мультилокусное секвенирование (MLST) или однолокусное секвенированине генов nrdA765, gltB, ЫаОХА (для Achromobacter spp.) и gyrB, hisA, fur (для Всс). С помощью MLST среди изолятов Burkholderia cepacia complex (Всс) были идентифицированы 4 вида: В. cenocepacia, В. cepacia, В. contaminans и В. multivorans. Из них 83,3% принадлежали к виду В. cenocepacia. В результате MLST штаммов P. aeruginosa удалось установить, что среди больных MB циркулирует международный эпидемический клон - ST235, который был причиной госпитальных инфекций в медицинских учреждениях различных стран. MLST позволило выявить генотипы В. cenocepacia ST709 и ST208, A. ruhlandii ST36 и S. aureus ST8 и подтвердить их эпидемическую значимость для больных MB в России. Заключение. Комплексный подход с использованием MALDI-TOF, амплификации и секвенирования специфических генов, 16SpPHK секвенирования, MLST и секвенирования полного генома (WGS) позволяет идентифицировать возбудителей с максимальной достоверностью, а также установить их эпидемическую значимость.

Авторы:

Издание: Сибирское медицинское обозрение
Год издания: 2019
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2019.-N 2.-С.70-79. Библ. 30 назв.
Просмотров: 29