ПОИСК НОВЫХ АНТИРЕТРОВИРУСНЫХ СОЕДИНЕНИЙ В ХИМИЧЕСКОМ ПРОСТРАНСТВЕ "БОЛЬШИХ ДАННЫХ" БИБЛИОТЕКИ SAVI

Аннотация:

Несмотря на значительные успехи в применении высокоактивной антиретровирусной терапии, разработка новых препаратов для лечения ВИЧ-инфекции остается актуальной, поскольку существующие лекарственные средства не обеспечивают полного излечения от ВИЧ-инфекции, вызывают серьезные побочные эффекты и приводят к возникновению резистентности. В 2015 году консорциумом американских и европейских ученых и специалистов начат проект по созданию библиотеки SAVI (Synthetically Accessible Virtual Inventory), в рамках которого было сгенерировано in silico свыше 283 млн. структур новых легко-синтезируемых органических молекул с целью поиска среди них более безопасных и эффективных фармакологических веществ. Мы разработали алгоритм сравнения больших химических баз данных (БД) на основе представления структурных формул в формате SMILES и оценили возможности выявления в БД SAVI новых антиретровирусных соединений. Проанализировав пересечение SAVI с 97 млн. структур БД PubChem, мы обнаружили, что лишь малая часть SAVI (-0,015%) представлена в PubChem, что свидетельствует о значительной новизне этой виртуальной библиотеки. Однако, среди этих структур было выявлено 632 соединения, протестированных на анти-ВИЧ активность, из которых 41 обладали искомой активностью. Таким образом, наши исследования впервые продемонстрировали, что SAVI является перспективным источником для поиска новых анти-ВИЧ соединений.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2019
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2019.-N 2.-С.73-79. Библ. 27 назв.
Просмотров: 22