СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МОДИФИКАЦИИ ПРОТЕОМА ПЛАЗМЫ КРОВИ БОЛЬНЫХ ЦЕРЕБРАЛЬНОЙ ИШЕМИЕЙ НА ОСНОВЕ МЕТОДА ВЭЖХ-МС/МС

Аннотация:

Исследованы относительные различия посттрансляционных модификаций (ПТМ) белков в образцах плазмы крови больных церебральной ишемией (ЦИ) и здоровых людей на основе метода сравнительного безметкового протеомного анализа на базе технологии тандемной ВЭЖХ-МС/МС. Для обнаружения ПТМ был выполнен множественный поиск МС/МС в базе данных Mascol с установленной переменной ПТМ с использованием программного обеспечения Progenesis LS-MS. В плазме больных ЦИ наблюдали увеличение доли посттрансляционно-модифицированных пептидов. Выявлены такие ПТМ белков, как фосфорилирование остатков серина, треонина и тирозина, ацетилирование остатков лизина и N-концевое апеллирование, убиквитинирование остатков лизина и дезамидирование остатков глутамина и аспарагина, имеющие отношение к клинически значимым процессам. Всесторонний анализ посттрансляционных модификаций (ПТМ) белков на уровне протеома имеет решающее значение для выяснения механизмов регулирования различных биологических процессов. ПТМ заключаются в ковалентной модификации белков после завершения их синтеза рибосомами. ПТМ возникают на всех этапах жизненного цикла клетки и сопровождаются изменением функций и пространственной структуры белков. При развитии патологии в крови появляется множество модифицированных форм белков, в норме отсутствующих или детектируемых в незначительных количествах. При исследовании биологического значения ПТМ часто важно знать относительную представленность конкретной модификации. Огромное количество научных работ направлено на выявление ПТМ и выяснение их биологических функций. Эффективной стратегией изучения изменений протеома крови является сравнительная протеомика. Безметковый относительный количественный протеомный анализ основан на сравнении площадей под пиками зарегистрированных пептидных ионов. Большинство ПТМ изменяют молекулярную массу белка, поэтому масс-спектрометрия (МС) является идеальным аналитическим инструментом для профилирования ПТМ протеома. Стандартной процедуры анализа ПТМ нет.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2019
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2019.-N 3.-С.251-257. Библ. 25 назв.
Просмотров: 27