Зависимость общей и безрецидивной выживаемости больных от молекулярно-генетического подтипа плоскоклеточного рака пищевода

Аннотация:

Плоскоклеточный рак пищевода (ПРП) представляет собой группу гетерогенных опухолей с различным прогнозом. В последние годы были выявлены различные молекулярные сигнатуры ПРП, отличные в разных популяциях. Целью исследования стало молекулярное типирование ПРП пациентов Юга России и оценка выживаемости больных с учетом выявленного молекулярно-генегического подтипа опухоли. Материалом для исследования послужили срезы FFPE-блоков 124 пациентов с ПРП. Выделение опухолевых и нормальных клеток пищевода осуществлялось путем лазерной микро-диссекции с бесконтактным захватом. Из клеток фенол-хлороформным методом была проведена экстракция 248 образцов ДНК. Для молекулярного типирования ПРП было проведено определение относительной копий-ности (CNV) 8 генов (CUL3, ATG7, SOX2, ТР63, YAP1, VGLL4, CDK6, KDM6A) методом Real-Time qPCR и определение 7 полиморфизмов (SNP) (NFE2L2 (c.85G>A), NOTCH1 (C.13790T), NOTCH1 (c.l451G>T), ZNF750 (С.4140А), ZNF750 (C.1621G>A), SMARCA4 (p.Q758*, С.22720Т), KMT2D (Q5170* , С.155080Т)) методом прямого секвенирова-ния по Сэнгеру. В ходе исследования у больных ПРП популяции Юга России выявлены SNP в генах NFE2L2, NOTCH1, SMARCA4, KMT2D и CNV генов CUL3, ATG7, SOX2, ТР63, YAP1, VGLL4, CDK6 и KDM6A, описанные ранее для популяций Восточной Европы, Канады и США. На основании дифференциальных отличий по SNP и CNV этих генов было верифицировано 3 молекулярно-генетических подтипа плоскоклеточного рака пищевода: ПРП-1 был установлен у 31.5%, ПРП-2 у 66.1% и ПРП-3 у 2.4% больных. При этом у больных ПРП с молекулярно-генетическим подтипом ПРП-2 установлены более высокие показатели выживаемости по сравнению с ПРП-1 и ПРП-3. Различия в выживаемости между тремя группами были статистически значимыми (р=0,00001). Таким образом, определение молекулярно-генетического подтипа ПРП является важным подходом для улучшения прогнозирования течения данного заболевания и возможности корректировки соответствующей терапии.

Авторы:

Издание: Вопросы онкологии
Год издания: 2019
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2019.-N 5.-С.691-700. Библ. 32 назв.
Просмотров: 29