Сравнительная геномика штаммов Escherichia coli АВ1157, АВ2463, АВ2494 и АВ1885

Аннотация:

Проведено полногеномное секвенирование штаммов АВ1157 и его мутантов — АВ1885 uvrB5, АВ2463 recA13, АВ2494 lexAl, дефектных по системам репарации ДНК, рекомбинации и мутагенеза. Установлено, что геномы штаммов АВ2463 гесА13 и АВ2494 lexA 1 содержат несколько сотен мутаций, которые отличают их от генома исходного штамма и образовались, по-видимому, при однократном воздействии N-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанидина на штамм АВ1157. При этом геном штамма АВ1885 uvrB5, полученного с помощью азотистой кислоты, содержит примерно в 10 раз меньше отличий от родительского штамма. Мутации в геномах штаммов АВ2463 гесА13 и АВ2494 lexA 1 представлены преимущественно транзициями СС на AT, распределены беспорядочно по геному и не совпадают по локализации. В свою очередь вклад спонтанных мутаций в изменения, произошедшие с изученными штаммами за период времени от их выделения до наших дней, незначителен. Также на молекулярном уровне аннотированы ранее известные генетические (фенотипические) маркеры изученного семейства штаммов.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2019
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2019.-N 3.-С.134-139. Библ. 21 назв.
Просмотров: 27