Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

ВИРУС БЕШЕНСТВА В КРАСНОЯРСКОМ КРАЕ: ДВЕ НЕЗАВИСИМЫХ ФИЛОГРУППЫ


Аннотация:

Опыт европейских стран показывает, что можно добиться благополучия по бешенству путем оральной вакцинации диких хищников. В России организован выпуск отечественной оральной вакцины, однако тактика ее применения должна быть адаптирована к особенностям природных очагов бешенства (обширные очаговые территории, особенности ландшафтной приуроченности, слабо выраженные естественные барьеры для распространения вируса и др.). Для периферии нозоареала более приемлема тактика барьерной вакцинации с учетом путей распространения инфекции. Цель работы - молекулярно-эпидемиологический анализ образцов вируса бешенства, выделенных на территории относительно изолированного природного очага у северо-восточных границ распространения «лисьего» бешенства: межгорные котловины в пределах Красноярского края и Республики Хакасия. Для молекулярно-генетического анализа использовали головной мозг диких и домашних животных, диагноз у которых был подтвержден методом МФА в региональных ветеринарных лабораториях. Всего исследовано 19 образцов, из них 17 собраны на территории Красноярского края в 2017-2018 гг., 2 - на территории Республики Хакасия в 2017 г. Из образцов головного мозга готовили 10 % суспензию в забуференном физиологическом растворе с рН 7,0, из которой выделяли суммарную нуклеиновую кислоту с использованием набора «РибоПреп» (АмплиСенс, Россия) согласно инструкции производителя; кДНК получали с помощью комплекта реактивов для обратной транскрипции «Реверта-L» (АмплиСенс, Россия). В ПЦР использовали праймеры Poleshchuk et. al. [2013] и набор реактивов ПЦР-РВ (ЗАО «Синтол», Россия). Секве-нирование проводили с теми же праймерами и набором BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit v. 1.1. (Applied Biosystems) на генетическом анализаторе ABI Genetic Analyzer 3500 xL. Нуклеотидные последовательности гена нуклеопротеина (ген N) длиной 1353 п.н. анализировали при помощи программы BioEditv. 7.1.5.0 [Hall, 1999]. Из международной базы данных GenBank были выбраны 113 последовательностей гена N изолятов вируса бешенства, выделенных на территории субъектов Российской Федерации: Республика Бурятия (2011-2012 гг., п=11), Забайкальский край (2014-2015 гг., п=4), Омская область (2011-2012 гг., п=9), Алтайский край (2011-2012 гг., п=6), Республика Хакасия (2011 г., п=б), Красноярский край (2002-2012 гг., п=17), Республика Тыва (2011-2012 гг., п=9). Также в анализ включены последовательности штаммов, выделенных на территории Казахстана (2014 г., п=6), Монголии (2005-2008 гг., п=27) и Автономного региона Внутренней Монголии Китайской Народной Республики (2011-2015 гг., п=18). Филогенетический анализ проводили в программе BEAST v. 1.7.4, используя фрагмент гена N длиной 1113 п.н. На бескорневом древе нуклеотидные последовательности гена нуклеопротеина образуют три группы. В группу 1 вошли последовательности гена N штаммов, выделенных на территориях Монголии, Китая и граничащих с ними регионов России (Республика Тыва, Республика Бурятия, Забайкальский край). Группа 2 образована нуклеотидными последовательностями изолятов из Минусинской котловины, расположенной в пределах Красноярского края и Республики Хакасия. На дендрограмме группы 1 и 2 имеют одного общего предка и дивергировали около 1981 г. В группе 3 представлены последовательности генов N вирусов бешенства, выделенных на территориях Казахстана, Алтая, Омской области и Назаровской котловины, расположенной в западной части Красноярского края. Изоляты из Красноярского края располагаются в двух филогенетически удаленных друг от друга группах. При рассмотрении географического расположения установлено, что ареал группы 2 включает Березовский, Каратузский, Курагинский, Минусинский, Новоселовский и Уярский районы, из которых два (Минусинский и Новоселовский) граничат с Хакасией. Изоляты, принадлежащие группе 3, выделены в Боготольском, Емельяновском, Назаровском, Сухобузимском, Ужурском и Шарыповском районах. Данные административные территории находятся на левом берегу р. Енисей и все, кроме Емельяновского и Сухобузимского районов, граничат с Кемеровской областью (Боготольский и Наза-ровский), Хакасией (Ужурский) или одновременно с двумя этими субъектами (Шарыповский). Таким образом, на территории Минусинской котловины циркулирует вирус бешенства генова-рианта, близкородственного тому, что выявляется в пределах степных ландшафтов Монголии и граничащих с ней территорий. Он же выявлен в восточной части Красноярского края (Курагинский район) вблизи границ с Иркутской областью. Можно предположить, что путем заноса и дальнейшего распространения инфекции является долина р. Енисей. Представители группы 3 распространены в степных ландшафтах Назаровской котловины на левом берегу р. Енисей вблизи границы с Кемеровской областью, на равнины которой они были занесены из Западной Сибири.

Авторы:

Яковчиц Н.В.
Бондарюк А.Н.
Адельшин Р.В.
Носков А.К.
Андаев Е.И.
Ботвинкин А.Д.

Издание: Дальневосточный журнал инфекционной патологии
Год издания: 2019
Объем: 3с.
Дополнительная информация: 2019.-N 37.-С.38-40. Библ. 0 назв.
Просмотров: 33

Рубрики
Ключевые слова
bioVISION
gene
pol
автономная
адаптированный
административный
алтай
анализ
анализатор
ареалы
базы
барьер
березов
бешенства
бешенство
благополучие
близкородственные
болезни
болеющие
бурятия
бытовые
вакцина
ветеринарные
вирус
включениями
внутренняя
восточный
выделение
выпуск
ген
гена
генетика
генетическ
генетическая
генов
географические
голова
готовность
граница
границы
групп
дальний
данные
двумя
девиво
диагноз
дикие
длина
долина
домашних
другого
европейское
естественная
животного
животные
животных
забайкалье
занос
западная
изолированное
изоляты
инструкции
инфекцией
иркутская
использование
исследования
казахстан
кемеровская
кислот
китайска
комплект
край
красноярский
лаборатории
ландшафты
левого
международна
метод
модификация
мозг
мозга
молекулярная
монголия
набор
народная
независимые
новоселов
нуклеиновые
нуклеопротеины
нуклеотидный
областей
образ
образования
образцов
обратная
обширные
общего
одновременная
одного
омская
опыт
оральная
организация
особенности
отечественные
относительная
очага
очаговая
очаговые
пола
помощи
последовательностей
праймер
праймеры
представители
прием
применение
принадлежащие
природная
природно-очаговые
программ
против
путей
путем
пцр
работа
равными
район
расположение
расположенные
распространение
раствор
реактивы
регион
региональная
республика
россии
российская
север
секвенирование
сибирь
случай-контроль
стран
субъект
суммарный
суспензии
сухого
тактика
территории
территория
транскрипции
три
тыва
учет
федерации
физиологическая
филогенетический
фрагмент
хакасия
хищники
цель
циркулирующий
части
шара
штамм
эпидемиологический
эпидемиология
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 3.145.91.3)
Яндекс.Метрика