Разработка метода идентификации индигенных лактобацилл кишечника при создании аутопробиотиков

Аннотация:

Цель. Разработать эффективный метод видовой идентификации лактобацилл, выделенных из толстой кишки человека, для последующего приготовления аутопробиотика на их основе. Объекты исследования - 159 штаммов индигенных лактобацилл, выделенных в 2015-2018 гг. от 78 пациентов, которым предстояла терапия антибиотиками. Получены чистые культуры лактобацилл и законсервированы для применения при восстановлении микробного баланса после антибиотикотерапии. Видовую идентификацию изолятов проводили с помощью биохимической тест-системы API 50 СН bioMerieux (Франция), генетической идентификации методами мультиплексной полимеразной цепной реакции (М-ПЦР) с 12 видами праймеров и 16S рРНК типирования. В результате с помощью биохимической идентификации определен вид 40 штаммов лактобацилл: L. rhamnosus (45%), L. plantarum (37,5%), L. paracasei (12,5%), L. brevis (2,5%) и L. fermentum (2,5%). Из них 36 аутоштаммов идентифицированы с помощью М-ПЦР и для 4 (11,1%) штаммов изменено видовое название. Всего с помощью М-ПЦР было идентифицировано 155 штаммов лактобацилл: L. rhamnosus (52,3%), L. plantarum (35,7%), L. paracasei (9,5%) и L. fermentum (2,5%). Для 17 аутоштаммов проведено 16S рРНК типирование, результаты которого в 100% случаев совпали с результатами М-ПЦР. Заключение. Видовая идентификация лактобацилл с использованием разработанного метода на основе М-ПЦР на 100% совпадает с результатами секвенирования участка гена, кодирующего 16S рРНК, и является более точной, чем биохимическая идентификация с использованием тест-системы API 50 СН bioMerieux.

Авторы:

Издание: Вопросы детской диетологии
Год издания: 2019
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2019.-N 3.-С.52-59. Библ. 17 назв.
Просмотров: 22